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Enregistrement W2070214412 · doi:10.1074/jbc.m101204200

Novel Members of the Human Oxysterol-binding Protein Family Bind Phospholipids and Regulate Vesicle Transport

2001· article· en· W2070214412 sur OpenAlexaff
Yongqin Xu, Yule Liu, Neale D. Ridgway, Christopher R. McMaster

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCaveolin-1 and cellular processes
Établissements canadiensNova Scotia Health AuthorityIzaak Walton Killam Health CentreDalhousie University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésOxysterolVesicleChemistryCell biologyPlasma protein bindingBiochemistryBiologyCholesterolMembrane

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Oxysterol-binding proteins (OSBPs) are a family of eukaryotic intracellular lipid receptors. Mammalian OSBP1 binds oxygenated derivatives of cholesterol and mediates sterol and phospholipid synthesis through as yet poorly undefined mechanisms. The precise cellular roles for the remaining members of the oxysterol-binding protein family remain to be elucidated. In yeast, a family of OSBPs has been identified based on primary sequence similarity to the ligand binding domain of mammalian OSBP1. Yeast Kes1p, an oxysterol-binding protein family member that consists of only the ligand binding domain, has been demonstrated to regulate the Sec14p pathway for Golgi-derived vesicle transport. Specifically, inactivation of the KES1 gene resulted in the ability of yeast to survive in the absence of Sec14p, a phosphatidylinositol/phosphatidylcholine transfer protein that is normally required for cell viability due to its essential requirement in transporting vesicles from the Golgi. We cloned the two human members of the OSBP family, ORP1 and ORP2, with the highest degree of similarity to yeast Kes1p. We expressed ORP1 and ORP2 in yeast lacking Sec14p and Kes1p function and found that ORP1 complemented Kes1p function with respect to cell growth and Golgi vesicle transport, whereas ORP2 was unable to do so. Phenotypes associated with overexpression of ORP2 in yeast were a dramatic decrease in cell growth and a block in Golgi-derived vesicle transport distinct from that of ORP1. Purification of ORP1 and ORP2 for ligand binding studies demonstrated ORP1 and ORP2 did not bind 25-hydroxycholesterol but instead bound phospholipids with both proteins exhibiting strong binding to phosphatidic acid and weak binding to phosphatidylinositol 3-phosphate. In Chinese hamster ovary cells, ORP1 localized to a cytosolic location, whereas ORP2 was associated with the Golgi apparatus, consistent with our vesicle transport studies that indicated ORP1 and ORP2 function at different steps in the regulation of vesicle transport.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,234
Écart entre enseignants0,216 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations96
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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