<i>Cytochrome b</i> sequences of ancient cattle and wild ox support phylogenetic complexity in the ancient and modern bovine populations
Notice bibliographique
Résumé
Mitochondrial DNA has been the traditional marker for the study of animal domestication, as its high mutation rate allows for the accumulation of molecular diversity within the time frame of domestic history. Additionally, it is exclusively maternally inherited and haplotypes become part of the domestic gene pool via actual capture of a female animal rather than by interbreeding with wild populations. Initial studies of British aurochs identified a haplogroup, designated P, which was found to be highly divergent from all known domestic haplotypes over the most variable portion of the D-loop. Additional analysis of a large and geographically representative sample of aurochs from northern and central Europe found an additional, separate aurochs haplotype, E. Until recently, the European aurochs appeared to have no matrilinear descendants among the publicly available modern cattle control regions sequenced; if aurochs mtDNA was incorporated into the domestic population, aurochs either formed a very small proportion of modern diversity or had been subsequently lost. However, a haplogroup P sequence has recently been found in a modern sample, along with a new divergent haplogroup called Q. Here we confirm the outlying status of the novel Q and E haplogroups and the modern P haplogroup sequence as a descendent of European aurochs, by retrieval and analysis of cytochrome b sequence data from twenty ancient wild and domesticated cattle archaeological samples.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».