Conformational analyses of a partially‐folded bioactive prodomain of human furin
Notice bibliographique
Résumé
The 81-residue multifunctional prodomain of human furin adopts only a partially-folded conformational state under near physiological conditions. By use of NMR spectroscopy, we demonstrate that the N-terminal residues 1-46 of the prodomain in 50% trifluoroethanol (TFE) populates backbone conformations containing a short helix, a beta-strand and a helix-loop-helix super-secondary structure with elements of tertiary interactions. (15)N NMR relaxation measurements indicate that the helix-loop-helix region has similar motional characteristics in the fast picosecond to nanosecond timescales. On the other hand, the intervening segment (residues 47-65) is predominantly unstructured with a long and highly flexible region surrounding the protease 'activation loop' followed by a partially helical segment in the C-terminal end. Interestingly, the helix-loop-helix "fold" was found to be populated even when excised out of the full-length prodomain, since a peptide fragment derived from residues Pro16-Arg49 can also form the helix-loop-helix structure in aqueous solution in the absence of TFE. Structure analyses reveal that two helices orient in an antiparallel fashion directed by the sharing of hydrophobic residues involved in helix-capping interactions. Very importantly, a positively-charged Lys residue replacing His43 in the 16-49 fragment imparts stability to the super-secondary structure at both acidic and neutral pH, while a hydrophobic residue Leu at position 43 appears to destabilize the helical conformation in the 31-44 region. As such, this study provides valuable insights into the structural properties of the furin prodomain in relation to its role in the folding of the furin zymogen and its inhibitory action toward furin.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».