Exclusion of non‐synonymous SNPs and a polyglutamine tract in SMRT/N‐CoR2 as common deleterious mutation for bipolar disorder in the Sagnenay‐Lac‐St‐Jean population
Notice bibliographique
Résumé
Bipolar disorder (BP) is a psychiatric illness with both genetic and environmental components occurring with a prevalence of slightly more than 1%. Our previous linkage and case/control studies have pointed to a susceptibility locus for BP in the 12q24.31 chromosomal region. Here, we investigated the possible involvement of the SMRT/N-CoR2 gene, which encodes for the nuclear receptor co-repressor 2. SMRT/N-CoR2 was retained as a candidate gene for BP because of its location within our candidate gene region and its interactions with thyroid hormone receptors. We screened SMRT/N-CoR2 for the presence of polymorphism/mutation in coding sequences and exon-intron junctions. Four non-synonymous SNPs and a polyglutamine tract (CAG repeat) in the coding exon 14 were analyzed in a case/control sample from the Saguenay-Lac-St-Jean (SLSJ) area of Quebec (213 cases and 214 controls). Our data indicated no significant allelic/genotypic association between any of the five mutations and bipolar phenotype when they were considered either individually or as haplotypes. Finally, the CAG repeat observed in SMRT/N-CoR2 did not demonstrate allelic instability and consequently it is unlikely that this polymorphism could be involved in the anticipation phenomenon reported for BP.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».