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Enregistrement W2070428981 · doi:10.1002/ajmg.b.30145

Exclusion of non‐synonymous SNPs and a polyglutamine tract in SMRT/N‐CoR2 as common deleterious mutation for bipolar disorder in the Sagnenay‐Lac‐St‐Jean population

2005· article· en· W2070428981 sur OpenAlexaffabout
Éric Shink, Mario Harvey, Monique Tremblay, Catherine Raymond, Michel Labbé, Bernard Gagné, Nicholas Barden

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Medical Genetics Part B Neuropsychiatric Genetics · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics and Neurodevelopmental Disorders
Établissements canadiensUniversité LavalCentre hospitalier de l'Université Laval
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGeneticsBiologyLocus (genetics)AlleleHaplotypeSingle-nucleotide polymorphismExonCandidate geneGeneGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Bipolar disorder (BP) is a psychiatric illness with both genetic and environmental components occurring with a prevalence of slightly more than 1%. Our previous linkage and case/control studies have pointed to a susceptibility locus for BP in the 12q24.31 chromosomal region. Here, we investigated the possible involvement of the SMRT/N-CoR2 gene, which encodes for the nuclear receptor co-repressor 2. SMRT/N-CoR2 was retained as a candidate gene for BP because of its location within our candidate gene region and its interactions with thyroid hormone receptors. We screened SMRT/N-CoR2 for the presence of polymorphism/mutation in coding sequences and exon-intron junctions. Four non-synonymous SNPs and a polyglutamine tract (CAG repeat) in the coding exon 14 were analyzed in a case/control sample from the Saguenay-Lac-St-Jean (SLSJ) area of Quebec (213 cases and 214 controls). Our data indicated no significant allelic/genotypic association between any of the five mutations and bipolar phenotype when they were considered either individually or as haplotypes. Finally, the CAG repeat observed in SMRT/N-CoR2 did not demonstrate allelic instability and consequently it is unlikely that this polymorphism could be involved in the anticipation phenomenon reported for BP.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,221
Score d'incertitude au seuil0,440

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,266
Écart entre enseignants0,260 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2005
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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