First Report of <i>Grapevine leafroll associated virus-3</i> in American <i>Vitis</i> spp. Grapevines in Washington State
Notice bibliographique
Résumé
Washington State is the largest producer of juice grapes (Vitis labruscana 'Concord' and Vitis labrusca 'Niagara') and ranks second in wine grape production in the United States. Grapevine leafroll disease (GLD) is the most wide spread and economically significant virus disease in wine grapes in the state. Previous studies (2) have shown that Grapevine leafroll associated virus-3 (GLRaV-3) is the predominant virus associated with GLD. However, little is known about the incidence and economic impact of GLD on juice and table grapes. Because typical GLD symptoms may not be obvious among these cultivars, the prevalence and economic impact of GLD in Concord and Niagara, the most widely planted cultivars in Washington State, has received little attention from the grape and nursery industries. During the 2005 growing season, 32 samples from three vineyards and one nursery of 'Concord' and three samples from one nursery of 'Niagara' were collected randomly. Petiole extracts were tested by single-tube reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR; 3) with primers LC 1 (5'-CGC TAG GGC TGT GGA AGT ATT-3') and LC 2 (5'-GTT GTC CCG GGT ACC AGA TAT-3'), specific for the heat shock protein 70 homologue (Hsp70h gene) of GLRaV-3 (GenBank Accession No. AF037268). One 'Niagara' nursery sample and eleven 'Concord' samples from the three vineyards tested positive for GLRaV-3, producing a single band of the expected size of 546 bp. The 'Niagara' and six of the 'Concord' RT-PCR products were cloned in pCR2.1 (Invitrogen Corp, Carlsbad, CA) and the sequences (GenBank Accession Nos. DQ780885, DQ780886, DQ780887, DQ780888, DQ780889, DQ780890, and DQ780891) compared with the respective sequence of a New York isolate of GLRaV-3 (GenBank Accession No. AF037268). The analysis revealed that GLRaV-3 isolates from 'Concord' and 'Niagara' share nucleotide identities of 94 to 98% and amino acid identities and similarities of 97 to 98% with the Hsp70h gene homologue of the New York isolate of GLRaV-3. Additional testing by double-antibody sandwich enzyme-linked immunosorbent assay (DAS-ELISA) using antibodies specific to GLRaV-3 (BIOREBA AG, Reinach, Switzerland) further confirmed these results in the 'Niagara' and two of the 'Concord' isolates. GLRaV-3 has previously been reported in labrusca cvs. Concord and Niagara in western New York (4) and Canada (1), but to our knowledge, this is the first report of GLRaV-3 in American grapevine species in the Pacific Northwest. Because wine and juice grapes are widely grown in proximity to each other in Washington State and grape mealybug (Pseudococcus maritimus), the putative vector of GLRaV-3, is present in the state vineyards, further studies will focus on the role of American grapevine species in the epidemiology of GLD. References: (1) D. J. MacKenzie et al. Plant Dis. 80:955, 1996. (2) R. R. Martin et al. Plant Dis. 89:763, 2005. (3) A. Rowhani et al. ICGV, Extended Abstracts, 13:148, 2000. (4) W. F. Wilcox et al. Plant Dis. 82:1062, 1998.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».