Isolation of enterovirus strains from children with preclinical Type 1 diabetes
Notice bibliographique
Résumé
AIMS: To develop methods for isolation of enterovirus strains from subjects with preclinical Type 1 diabetes and evaluate if their presence in stools is associated with beta-cell damage. METHODS: The study subjects were participants of the Finnish Type 1 Diabetes Prediction and Prevention Study (DIPP). The prospectively followed birth cohort comprised 12 children who turned positive for diabetes-associated autoantibodies during the follow-up (case children) and 53 controls matched for date of birth, sex and HLA-DQB1 alleles. Altogether, 878 stool samples were analysed for the presence of enterovirus RNA by RT-PCR followed by virus isolation and partial sequencing of viral genome. Enterovirus antibodies and RNA were simultaneously analysed from serum. RESULTS: Eleven enterovirus infections were diagnosed in case children and 42 infections in control children by the presence of viral RNA in stools. The proportion of children who were repeatedly enterovirus RNA-positive stools was higher among case than control children (42% vs. 11% of children; P=0.02). Combined serum (antibody and RT-PCR) and stool analyses indicated at least one enterovirus infection in 83% of the case children before the appearance of autoantibodies, while only 42% of the control children had infection by the same age (P=0.006). Twelve enterovirus strains were isolated from case children and 38 strains from control children. CONCLUSIONS: This protocol makes it possible to isolate a large number of enterovirus strains from prediabetic subjects. The findings suggest that enterovirus infections may be associated with the beta-cell damaging process.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».