Transcriptomic and proteomic analyses in bone tumor cells: Deciphering parathyroid hormone-related protein regulation of the cell cycle and apoptosis
Notice bibliographique
Résumé
Giant cell tumor of bone (GCT) is an aggressive skeletal tumor characterized by local bone destruction, high recurrence rates, and metastatic potential. Previous works in our laboratory, including functional assays, have shown that neutralization of parathyroid hormone-related protein (PTHrP) in the cell environment inhibits cell proliferation and induces cell death in GCT stromal cells, indicating a role for PTHrP in cell propagation and survival. The objective of this study was to investigate the global gene and protein expression patterns of GCT cells in order to identify the underlying pathways and mechanisms of neoplastic proliferation provided by PTHrP in the bone microenvironment. Primary stromal cell cultures from 10 patients with GCT were used in this study. Cells were exposed to optimized concentrations of either PTHrP peptide or anti-PTHrP neutralizing antiserum and were analyzed with both cDNA microarray and proteomic microarray assays in triplicate. Hierarchical clustering and principal component analyses confirmed that counteraction of PTHrP in GCT stromal cells results in a clear-cut gene expression pattern distinct from all other treatment groups and the control cell line human fetal osteoblast (hFOB). Multiple bioinformatics tools were used to analyze changes in gene/protein expression and identify important gene ontologies and pathways common to this anti-PTHrP-induced regulatory gene network. PTHrP neutralization interferes with multiple cell survival and apoptosis signaling pathways by triggering both death receptors and cell cycle-mediated apoptosis, particularly via the caspase pathway, TRAIL pathway, JAK-STAT signaling pathway, and cyclin E/CDK2-associated G1/S cell cycle progression. These findings indicate that PTHrP neutralization exhibits anticancer potential by regulating cell-cycle progression and apoptosis in bone tumor cells, with the corollary being that PTHrP is a pro-neoplastic factor that can be targeted in the treatment of bone tumors.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».