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Enregistrement W2070577722 · doi:10.4161/psb.27723

CGI-58, a key regulator of lipid homeostasis and signaling in plants, also regulates polyamine metabolism

2014· article· en· W2070577722 sur OpenAlexafffund
Sunjung Park, Jantana Keereetaweep, Christopher N. James, Satinder K. Gidda, Kent D. Chapman, Robert T. Mullen, John M. Dyer

Notice bibliographique

RevuePlant Signaling & Behavior · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePolyamine Metabolism and Applications
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilUniversity of GuelphU.S. Department of AgricultureU.S. Department of Energy
Mots-clésSpermidineBiologyPolyaminePutrescineArabidopsisBiochemistryMutantLipid metabolismCell biologyWild typeGeneEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Comparative Gene Identification-58 (CGI-58) is an α/β hydrolase-type protein that regulates lipid homeostasis and signaling in eukaryotes by interacting with and stimulating the activity of several different types of proteins, including a lipase in mammalian cells and a peroxisomal ABC transporter (PXA1) in plant cells. Here we show that plant CGI-58 also interacts with spermidine synthase 1 (SPDS1), an enzyme that plays a central role in polyamine metabolism by converting putrescine into spermidine. Analysis of polyamine contents in Arabidopsis thaliana plants revealed that spermidine levels were significantly reduced, and putrescine increased, in both cgi-58 and cgi-58/pxa1 mutant plants, relative to pxa1 mutant or wild-type plants. Evaluation of polyamine-related gene expression levels, however, revealed similar increases in transcript abundance in all mutants, including cgi-58, pxa1, and cgi-58/pxa1, in comparison to wild type. Taken together, the data support a model whereby CGI-58 and PXA1 contribute to the regulation of polyamine metabolism at the transcriptional level, perhaps through a shared lipid-signaling pathway, and that CGI-58 also acts independently of PXA1 to increase spermidine content at a post-transcriptional level, possibly through protein-protein interaction with SPDS1.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,037
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,234
Écart entre enseignants0,224 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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