<i>APOE</i>,<i>MAPT</i>, and<i>SNCA</i>Genes and Cognitive Performance in Parkinson Disease
Notice bibliographique
Résumé
IMPORTANCE: Cognitive impairment is a common and disabling problem in Parkinson disease (PD) that is not well understood and is difficult to treat. Identification of genetic variants that influence the rate of cognitive decline or pattern of early cognitive deficits in PD might provide a clearer understanding of the etiopathogenesis of this important nonmotor feature. OBJECTIVE: To determine whether common variation in the APOE, MAPT, and SNCA genes is associated with cognitive performance in patients with PD. DESIGN, SETTING, AND PARTICIPANTS: We studied 1079 PD patients from 6 academic centers in the United States who underwent assessments of memory (Hopkins Verbal Learning Test-Revised [HVLT-R]), attention and executive function (Letter-Number Sequencing Test and Trail Making Test), language processing (semantic and phonemic verbal fluency tests), visuospatial skills (Benton Judgment of Line Orientation test), and global cognitive function (Montreal Cognitive Assessment). Participants underwent genotyping for the APOE ε2/ε3/ε4 alleles, MAPT H1/H2 haplotypes, and SNCA rs356219. We used linear regression to test for association between genotype and baseline cognitive performance with adjustment for age, sex, years of education, disease duration, and site. We used a Bonferroni correction to adjust for the 9 comparisons that were performed for each gene. MAIN OUTCOMES AND MEASURES: Nine variables derived from 7 psychometric tests. RESULTS: The APOE ε4 allele was associated with lower performance on the HVLT-R Total Recall (P = 6.7 × 10(-6); corrected P [Pc] = 6.0 × 10(-5)), Delayed Recall (P = .001; Pc = .009), and Recognition Discrimination Index (P = .004; Pc = .04); a semantic verbal fluency test (P = .002; Pc = .02); the Letter-Number Sequencing Test (P = 1 × 10(-5); Pc = 9 × 10(-5)); and Trail Making Test B minus Trail Making Test A (P = .002; Pc = .02). In a subset of 645 patients without dementia, the APOE ε4 allele was associated with lower scores on the HVLT-R Total Recall (P = .005; Pc = .045) and the semantic verbal fluency (P = .005; Pc = .045) measures. Variants of MAPT and SNCA were not associated with scores on any tests. CONCLUSIONS AND RELEVANCE: Our data indicate that the APOE ε4 allele is an important predictor of cognitive function in PD across multiple domains. Among PD patients without dementia, the APOE ε4 allele was only associated with lower performance on word list learning and semantic verbal fluency, a pattern more typical of the cognitive deficits seen in early Alzheimer disease than PD.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».