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Enregistrement W2070594298 · doi:10.1128/aac.02934-14

A <i>bla</i> <sub>VIM-2</sub> Plasmid Disseminating in Extensively Drug-Resistant Clinical Pseudomonas aeruginosa and Serratia marcescens Isolates

2014· letter· en· W2070594298 sur OpenAlexaff
Elisabet Vilacoba, Cecilia Medina Quiroga, Mariano Pistorio, Àngela Famiglietti, Hernán B. Rodríguez, Jaime Kovensky, Maxime Déraspe, Frédéric Raymond, Paul H. Roy, Daniela Centrón

Notice bibliographique

RevueAntimicrobial Agents and Chemotherapy · 2014
Typeletter
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAntibiotic Resistance in Bacteria
Établissements canadiensUniversité LavalCentre hospitalier universitaire de Québec
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSerratia marcescensPlasmidMicrobiologyEnterobacteriaceaeBiologyPseudomonas aeruginosaHorizontal gene transferMobile genetic elementsDrug resistanceCarbapenem-resistant enterobacteriaceaeGeneBacteriaGeneticsEscherichia coliPhylogenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Infections caused by carbapenem-resistant Enterobacteriaceae isolates are an issue of major global concern (1). Genes coding for metallo-β-lactamases (MβLs) identified in clinical isolates are associated with mobile elements and subject to horizontal genetic transfer (HGT) events (2–6). VIM-2 is present on numerous plasmids, but only pNOR-2000 from Pseudomonas aeruginosa COL-1 from France (7, 8) and pLD209 from Pseudomonas putida LD209 from Argentina (9) have been completely sequenced. Here, we report the complete sequence and characterization of plasmid pDCPR1 harboring a blaVIM-2 gene cassette in a Tn402-type class 1 integron, which was isolated from two extensively drug-resistant strains: P. aeruginosa 802 (from a burn patient at the Hospital Municipal de Quemados, Argentina, 2005) and S. marcescens 68313 (Sanatorio Sagrado Corazón, Argentina, 2012).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,005
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,016

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,005
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0090,005
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,258
Écart entre enseignants0,247 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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