Temporal Gene Expression Profiling of the Wheat Leaf Rust Pathosystem Using cDNA Microarray Reveals Differences in Compatible and Incompatible Defence Pathways
Notice bibliographique
Résumé
In this study, we detail the construction of a custom cDNA spotted microarray containing 7728 wheat ESTs and the use of the array to identify host genes that are differentially expressed upon challenges with leaf rust fungal pathogens. Wheat cultivar RL6003 (Thatcher Lr1) was inoculated with Puccinia triticina virulence phenotypes BBB (incompatible) or TJB (7-2) (compatible) and sampled at four different time points (3, 6, 12, and 24 hours) after inoculation. Transcript expression levels relative to a mock treatment were measured. One hundred ninety two genes were found to have significantly altered expression between the compatible and incompatible reactions. Among those were genes involved in photosynthesis, the production of reactive oxygen species, ubiquitination, signal transduction, as well as in the shikimate/phenylpropanoid pathway. These data indicate that various metabolic pathways are affected, some of which might be used by RL6003 to mount a coordinated defense against an incompatible fungal pathogen.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».