Genetic diversity of <i> <scp>P</scp> uccinia striiformis </i> from cereals in <scp>A</scp> lberta, <scp>C</scp> anada
Notice bibliographique
Résumé
Stripe rust of wheat caused by P uccinia striiformis f. sp. tritici has recently become a production problem on wheat in A lberta, C anada, and stripe rust of barley caused by P . striiformis f. sp. hordei occurs regularly. A total of 261 isolates of P . striiformis were collected from wheat, barley, H ordeum jubatum and triticale plants in A lberta, C anada from 2007 to 2012, and compared to isolates from other provinces and the USA . The genetic diversity of the pathogen was assessed using 11 simple sequence repeat ( SSR ) markers and by examining a length polymorphism in the ribosomal DNA ( rDNA ) intergenic spacer 1 ( IGS 1) region. A total of 28 SSR genotypes were detected within Alberta. The 13 genotypes common on wheat ( P . striiformis f. sp. tritici ) were distinct from the 15 genotypes common on barley ( P . striiformis f. sp. hordei ). Four SSR genotypes, two within each forma specialis, represented 85% of the isolates recovered. Genotypic diversity was low, population genetic analysis indicated a clonal structure, and the genotypes were widely dispersed. In both formae speciales, the dominant genotype varied between years. The second most common P . striiformis f. sp. hordei genotype was found to be more closely related to older P . striiformis f. sp. tritici genotypes from the USA than to other P . striiformis f. sp. hordei genotypes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».