Genetic diversity of <i> <scp>P</scp> uccinia striiformis </i> from cereals in <scp>A</scp> lberta, <scp>C</scp> anada
Notice bibliographique
Résumé
Stripe rust of wheat caused by P uccinia striiformis f. sp. tritici has recently become a production problem on wheat in A lberta, C anada, and stripe rust of barley caused by P . striiformis f. sp. hordei occurs regularly. A total of 261 isolates of P . striiformis were collected from wheat, barley, H ordeum jubatum and triticale plants in A lberta, C anada from 2007 to 2012, and compared to isolates from other provinces and the USA . The genetic diversity of the pathogen was assessed using 11 simple sequence repeat ( SSR ) markers and by examining a length polymorphism in the ribosomal DNA ( rDNA ) intergenic spacer 1 ( IGS 1) region. A total of 28 SSR genotypes were detected within Alberta. The 13 genotypes common on wheat ( P . striiformis f. sp. tritici ) were distinct from the 15 genotypes common on barley ( P . striiformis f. sp. hordei ). Four SSR genotypes, two within each forma specialis, represented 85% of the isolates recovered. Genotypic diversity was low, population genetic analysis indicated a clonal structure, and the genotypes were widely dispersed. In both formae speciales, the dominant genotype varied between years. The second most common P . striiformis f. sp. hordei genotype was found to be more closely related to older P . striiformis f. sp. tritici genotypes from the USA than to other P . striiformis f. sp. hordei genotypes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».