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Enregistrement W2070821265 · doi:10.1111/ppa.12094

Genetic diversity of <i> <scp>P</scp> uccinia striiformis </i> from cereals in <scp>A</scp> lberta, <scp>C</scp> anada

2013· article· en· W2070821265 sur OpenAlexafffundabout
Michael D. Holtz, Jennifer L. Zantinge, K. Xi

Notice bibliographique

RevuePlant Pathology · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueWheat and Barley Genetics and Pathology
Établissements canadiensAgriculture Food and Rural Development
Organismes subventionnairesAlberta Crop Industry Development Fund
Mots-clésBiologyTriticaleGenotypeGenetic diversityPopulationRibosomal DNAIntergenic regionBotanyHorticultureGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Stripe rust of wheat caused by P uccinia striiformis f. sp. tritici has recently become a production problem on wheat in A lberta, C anada, and stripe rust of barley caused by P . striiformis f. sp. hordei occurs regularly. A total of 261 isolates of P . striiformis were collected from wheat, barley, H ordeum jubatum and triticale plants in A lberta, C anada from 2007 to 2012, and compared to isolates from other provinces and the USA . The genetic diversity of the pathogen was assessed using 11 simple sequence repeat ( SSR ) markers and by examining a length polymorphism in the ribosomal DNA ( rDNA ) intergenic spacer 1 ( IGS 1) region. A total of 28 SSR genotypes were detected within Alberta. The 13 genotypes common on wheat ( P . striiformis f. sp. tritici ) were distinct from the 15 genotypes common on barley ( P . striiformis f. sp. hordei ). Four SSR genotypes, two within each forma specialis, represented 85% of the isolates recovered. Genotypic diversity was low, population genetic analysis indicated a clonal structure, and the genotypes were widely dispersed. In both formae speciales, the dominant genotype varied between years. The second most common P . striiformis f. sp. hordei genotype was found to be more closely related to older P . striiformis f. sp. tritici genotypes from the USA than to other P . striiformis f. sp. hordei genotypes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,561
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,188
Écart entre enseignants0,172 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2013
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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