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Enregistrement W2070894488 · doi:10.1111/1556-4029.12005

Analysis of the <scp>NMI</scp>01 Marker for a Population Database of <scp><i>Cannabis</i></scp> Seeds

2012· article· en· W2070894488 sur OpenAlexaff
Nicholas Shirley, Lindsay Allgeier, Tommy LaNier, Heather Miller Coyle

Notice bibliographique

RevueJournal of Forensic Sciences · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCannabis and Cannabinoid Research
Établissements canadiensMiller Group (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCannabis sativaDatabaseLocus (genetics)PopulationMicrosatelliteBiologyGenotypeCannabisAlleleReference databaseGeneticsBiotechnologyHorticultureMedicineGeneComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We have analyzed the distribution of genotypes at a single hexanucleotide short tandem repeat (STR) locus in a Cannabis sativa seed database along with seed-packaging information. This STR locus is defined by the polymerase chain reaction amplification primers CS1F and CS1R and is referred to as NMI01 (for National Marijuana Initiative) in our study. The population database consists of seed seizures of two categories: seed samples from labeled and unlabeled packages regarding seed bank source. Of a population database of 93 processed seeds including 12 labeled Cannabis varieties, the observed genotypes generated from single seeds exhibited between one and three peaks (potentially six alleles if in homozygous state). The total number of observed genotypes was 54 making this marker highly specific and highly individualizing even among seeds of common lineage. Cluster analysis associated many but not all of the handwritten labeled seed varieties tested to date as well as the National Park seizure to our known reference database containing Mr. Nice Seedbank and Sensi Seeds commercially packaged reference samples.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,114
Score d'incertitude au seuil0,361

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,003
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,324
Écart entre enseignants0,295 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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