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Enregistrement W2070946478 · doi:10.1002/mbo3.226

AmgRS‐mediated envelope stress‐inducible expression of the <i>mexXY</i> multidrug efflux operon of <i>Pseudomonas aeruginosa</i>

2014· article· en· W2070946478 sur OpenAlexafffund
Calvin Ho‐Fung Lau, Thomas Krahn, C. M. Gilmour, Erin Mullen, Keith Poole

Notice bibliographique

RevueMicrobiologyOpen · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEscherichia coli research studies
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchCystic Fibrosis Canada
Mots-clésEffluxPseudomonas aeruginosaOperonMicrobiologyMultiple drug resistanceBiologyChemistryAntibioticsBacteriaGeneticsGeneEscherichia coli

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

AmgRS is an envelope stress-responsive two-component system and aminoglycoside resistance determinant in Pseudomonas aeruginosa that is proposed to protect cells from membrane damage caused by aminoglycoside-generated mistranslated polypeptides. Consistent with this, a ΔamgR strain showed increased aminoglycoside-promoted membrane damage, damage that was largely absent in AmgRS-activated amgS-mutant strains. Intriguingly, one such mutation, V121G, while providing for enhanced resistance to aminoglycosides, rendered P. aeruginosa susceptible to several ribosome-targeting nonaminoglycoside antimicrobials that are inducers and presumed substrates of the MexXY-OprM multidrug efflux system. Surprisingly, the amgSV 121G mutation increased mexXY expression threefold, suggesting that export of these nonaminoglycosides was compromised in the amgSV 121G mutant. Nonetheless, a link was established between AmgRS activation and mexXY expression and this was confirmed in studies showing that aminoglycoside-promoted mexXY expression is dependent on AmgRS. While nonaminoglycosides also induced mexXY expression, this was not AmgRS-dependent, consistent with these agents not generating mistranslated polypeptides and not activating AmgRS. The aminoglycoside inducibility of mexXY was abrogated in a mutant lacking the AmgRS target genes htpX and PA5528, encoding a presumed cytoplasmic membrane-associated protease and a membrane protein of unknown function, respectively. Thus, aminoglycoside induction of mexXY is a response to membrane damage and activation of the AmgRS two-component system.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,237
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations52
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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