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Enregistrement W2070959560 · doi:10.1111/jbi.12309

Miocene and Pliocene colonization of the Central American Isthmus by the weakly electric fish <i><scp>B</scp>rachyhypopomus occidentalis</i> (Hypopomidae, Gymnotiformes)

2014· article· en· W2070959560 sur OpenAlexafffund
Sophie Picq, Fernando Alda, Rüdiger Krahe, Eldredge Bermingham

Notice bibliographique

RevueJournal of Biogeography · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueFish biology, ecology, and behavior
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesSmithsonian Tropical Research InstituteNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMcGill UniversitySmithsonian Institution
Mots-clésBiological dispersalBiologyVicariancePhylogeographyLand bridgeLineage (genetic)ColonizationEcologyMolecular clockBiogeographyPanamaPhylogenetic treeEvolutionary biologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Aim We present a molecular phylogenetic and biogeographical analysis of B rachyhypopomus occidentalis , one of the few gymnotiform electric fish in Central America, to further understand the colonization and diversification processes of primary freshwater fishes over the Central American Isthmus. Location Lower Central America. Methods We used Bayesian and maximum‐likelihood phylogenetic reconstructions using mitochondrial [cytochrome c oxidase subunit I ( COI ) and ATP synthase 6 and 8 ( ATPase 8 / 6 )] and nuclear ( RAG1 and rhodopsin) genes and extensive geographical sampling, together with molecular clock analyses and tests of biogeographical scenarios to assess the timing and mode of dispersal and diversification. Results We identified high levels of phylogeographical structure, with a highly divergent lineage composed of individuals from western Atlantic Panama (Bocas), sister to all trans‐Andean South American and Central American lineages. The Pacific slope of Panama showed surprisingly little genetic structure compared with the Atlantic slope. Molecular‐clock and biogeographical analyses support two waves of colonization originating from South America: a first dispersal event in the late Miocene with the Bocas lineage as the only relict, and a second major colonization in the late Pliocene leading to the establishment of B. occidentalis in all central and eastern Panama drainages. Main conclusions The genetic structure of B. occidentalis over the Isthmian landscape reflects the progressive, complex and dynamic geological evolution of the region. Our results support multiple colonization events, with an ancient Miocene dispersal event followed by a recent rapid expansion in the late Pliocene, probably facilitated by the final closure of the Isthmus, which provided an important corridor.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,064
Score d'incertitude au seuil0,485

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,192
Écart entre enseignants0,188 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations39
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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