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Enregistrement W2071031703 · doi:10.1091/mbc.e08-07-0748

Genetic Hypervariability in Two Distinct Deuterostome Telomerase Reverse Transcriptase Genes and their Early Embryonic Functions

2008· article· en· W2071031703 sur OpenAlexaff
Trystan B. Wells, Guanglei Zhang, Zenon Harley, Homayoun Vaziri

Notice bibliographique

RevueMolecular Biology of the Cell · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTelomeres, Telomerase, and Senescence
Établissements canadiensUniversity of TorontoOntario Institute for Cancer Research
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyDeuterostomeReverse transcriptaseTelomeraseGeneEmbryonic stem cellGeneticsRetrotransposonTelomerase reverse transcriptaseVirologyRNAGenomePhylogenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Functional proteins of complex eukaryotes within the same species are rather invariant. A single catalytic component of telomerase TERT is essential for an active telomerase complex that maintains telomeres. Surprisingly, we have identified two paralogous SpTERT-L and SpTERT-S genes with novel domains in Strongylocentrotus purpuratus (purple sea urchin). The SpTERT-S and SpTERT-L genes were differentially expressed throughout embryogenesis. An unusual germline nucleotide substitution and amino acid variation was evident in these TERTs. The hypervariability of SpTERT-S haplotypes among different individuals reached unprecedented levels of pi > 0.2 in exon 11 region. The majority of nucleotide changes observed led to nonsynonymous substitutions creating novel amino acids and motifs, suggesting unusual positive selection and rapid evolution. The majority of these variations were in domains involved in binding of SpTERT to its RNA component. Despite hypervariability at protein level, SpTERT-S conferred telomerase activity, and its suppression during early embryogenesis led to arrest at late mesenchymal blastula. Domain exchange and embryo rescue experiments suggested that SpTERT may have evolved functions unrelated to classic telomerase activity. We suggest that telomerase has a specific and direct function that is essential for integration of early polarity signals that lead to gastrulation. Identification of these unique hypervariable telomerases also suggests presence of a diversity generation mechanism that inculcates hypervariable telomerases and telomere lengths in germline.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,237
Écart entre enseignants0,224 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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