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Enregistrement W2071070516 · doi:10.1002/path.2160

Role of BRAF‐V600E in the serrated pathway of colorectal tumourigenesis

2007· article· en· W2071070516 sur OpenAlexaff
Parham Minoo, M Moyer, J R Jass

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Pathology · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGenetic factors in colorectal cancer
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesBayer Corporation
Mots-clésMLH1Microsatellite instabilityCancer researchV600EColorectal cancerGene silencingDNA mismatch repairDNA methylationMutationBiologyMethylationMedicineCancerGeneGeneticsGene expressionAllele

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

There is increasing evidence for an alternative pathway of sporadic colorectal tumourigenesis that is associated with DNA microsatellite instability (MSI), due to methylation and loss of expression of the mismatch repair gene MLH1. Recent studies have highlighted a serrated pathway of colorectal cancer (CRC) in which serrated polyps with activating mutations in BRAF progress to CRCs with MSI following methylation and silencing of MLH1. The present study provides a novel mechanistic experimental model for these clinical observations. We investigated the role of BRAF activating mutation (BRAF-V600E) in colorectal tumourigenesis by studying the effects of forced expression of BRAF-V600E in the 'normal' colon epithelial NCM460 cell line and by targeting endogenous BRAF-V600E in MSI-High (MSI-H) colon cancer cell lines. The findings indicate that BRAF mutation in colon epithelial cells contributes to a gain in resistance towards apoptotic stimuli, which is likely to be an important characteristic of pre-malignant serrated lesions. BRAF-V600E also plays a role in the development and maintenance of transformed and invasive phenotypes in colon epithelial cells. Our findings also suggest that BRAF mutation potentiates promoter hypermethylation of the MLH1 gene promoter. Together, these results highlight BRAF as a potential target for therapeutic intervention in sporadic MSI-H colorectal cancers.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,274
Écart entre enseignants0,261 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations93
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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