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Enregistrement W2071149898 · doi:10.1002/gcc.22049

Differential nuclear organization of translocation‐prone genes in nonmalignant B cells from patients with t(14;16) as compared with t(4;14) or t(11;14) myeloma

2013· article· en· W2071149898 sur OpenAlexafffund
L. Martin, Jana Harizanova, Christiaan H. Righolt, George Zhu, Sabine Mai, Andrew R. Belch, Linda M. Pilarski

Notice bibliographique

RevueGenes Chromosomes and Cancer · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMultiple Myeloma Research and Treatments
Établissements canadiensUniversity of ManitobaCancerCare ManitobaUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésChromosomal translocationMultiple myelomaGeneDifferential (mechanical device)BiologyCancer researchMedicineMolecular biologyPathologyImmunologyGeneticsPhysics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Gene organization in nonmalignant B cells from t(4;14) and t(11;14) multiple myeloma (MM) patients differs from that of healthy donors. Among recurrent IGH translocations in MM, the frequency of t(4;14) (IGH and FGFR3) or t(11;14) (IGH and CCND1) is greater than the frequency of t(14;16) (IGH and MAF). Gene organization in t(14;16) patients may influence translocation potential of MAF with IGH. In patients, three-dimensional FISH revealed the positions of IGH, CCND1, FGFR3, and MAF in nonmalignant B cells that are likely similar to those when MM first arose, compared with B cells from healthy donors. Overall, IGH occupies a more central nuclear position while MAF is more peripherally located. However, for B cells from t(4;14) and t(11;14) patients, IGH and FGFR3, or IGH and CCND1 are found in spatial proximity: IGH and MAF are not. This differs in B cells from t(14;16) patients and healthy donors where IGH is approximately equidistant to FGFR3, CCND1, and MAF, suggesting that gene organization in t(14;16) patients is different from that in t(4;14) or t(11;14) patients. Translocations between IGH and MAF may arise only in the absence of close proximity to the more frequent partners, as appears to be the case for individuals who develop t(14;16) MM.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,092
Score d'incertitude au seuil0,998

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,237
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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