On the phylogeny of members of <i>Ceratocystis</i> s.s. and <i>Ophiostoma</i> that possess different anamorphic states, with emphasis on the anamorph genus <i>Leptographium</i>, based on partial ribosomal DNA sequences
Notice bibliographique
Résumé
Phylogenetic analysis of partial ribosomal DNA sequences was undertaken to assess the phylogenetic distribution of ophiostomatoid anamorphs with an emphasis on members of Leptographium and the generic limits of Ceratocystis sensu lato Ell. & Halst. Molecular data identified one group of Ophiostoma species with anamorphs assignable to Pesotum and Leptographium that appears to be monophyletic. This study also showed that, based on molecular characters, Pesotum pini (Hutchison & Reid) Okada and all Leptographium strains tested, including L. terebrantis Barras & Perry, L. lundbergii Lag. & Melin, and L. procerum (Kendr.) Wingf., could be placed among Ophiostoma species. With regard to the anamorphs of Ophiostoma, we determined that the separation of Leptographium from Pesotum, although convenient, is artificial. The partial ribosomal DNA sequences also confirm that Europhium should be considered a synonym of Ophiostoma. The phylogenetic position of species of Ceratocystis sensu lato with Chalara-like, Knoxdaviesia, and Gabarnaudia anamorphs is also discussed.Key words: Ceratocystis, Ophiostoma, Leptographium, partial rDNA sequences, phylogeny.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».