Suggested actions from the Melbourne HVP Information Seminar
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The Human Variome Project (HVP; www.humanvariomeproject.org) was initiated at a meeting in June 2006 and addressed the problems of collecting genetic information and generated 96 recommendations (http://www.nature.com/ng/journal/v39/n4/full/ng0407-423.html) to overcome these, with the focus on Mendelian disease. A considerable number of projects have been added, to those that have been ongoing for a number of years, since that meeting. Also, a planning meeting is to be held May 25-29, 2008 in Spain (http://www.humanvariomeproject.org/HVP2008/).A dramatic boost has been given to the HVP by the preparedness and action of the International Society for Gastrointestinal Hereditary Tumours (InSiGHT; www.insight-group.org), to, in order to improve their own informatics systems for dealing with inherited colon cancer, set up a pilot system for collection and databasing mutation and phenotype information, i.e. to act as pilot for the HVP. This is then intended to be transferred to other genes and countries. Much relevant activity in this project is being led from and is based in Melbourne.This meeting in Melbourne has been conceived to review the current local situation and plans for the future. We are privileged that Myles Axton, Editor of Nature Genetics, a strong supporter of the HVP (see April 2007 Nature Genetics Editorial) and who has some ideas in the area (see August 2007 Nature Genetics Editorial) agreed to be keynote speaker.We proposed that the output of this meeting be published and, with permission, the abstracts and presentations placed on the website (www.humanvariomeproject.org/?p=Melbourne_Meeting). We also hope it will inform the May HVP Planning Meeting.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,013 | 0,028 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,004 | 0,001 |
| Communication savante | 0,011 | 0,007 |
| Science ouverte | 0,004 | 0,009 |
| Intégrité de la recherche | 0,024 | 0,018 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,304 | 0,153 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».