The SMS domain of Trs23p is responsible for the in vitro appearance of the TRAPP I complex in<i>Saccharomyces cerevisiae</i>
Notice bibliographique
Résumé
Saccharomyces cerevisiae transport protein particle (TRAPP) is a family of related multisubunit complexes required for endoplasmic reticulum-to-Golgi transport (TRAPP I), endosome-to-Golgi transport (TRAPP II) or cytosol to vacuole targeting (TRAPP III). To gain insight into the relationship between these complexes, we generated random and targeted mutations in the Trs23p core subunit. Remarkably, at physiological salt concentrations only two peaks (TRAPP I and a high molecular weight peak) are detected in wild-type cells. As the salt was raised, the high molecular weight peak resolved into TRAPP II and III peaks. Deletion of a Saccharomycotina-specific domain of Trs23p resulted in destabilization of TRAPP I but had no effect on TRAPP II or III. This mutation had no observable growth phenotype, normal levels of Ypt1p-directed guanine nucleotide exchange factor activity in vivo and did not display any in vivo nor in vitro blocks in membrane traffic. Biochemical analysis indicated that TRAPP I could be produced from the TRAPP II/III peak in vitro by increasing the salt concentration. Our data suggest that the SMS domain of Trs23p is responsible for the in vitro appearance of TRAPP I in S. cerevisiae. The implications of these findings are discussed.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».