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Genetic study ofSOX9 in a case of campomelic dysplasia

2001· article· en· W2071708568 sur OpenAlexaff
Jennifer Giordano, Heather Prior, J. Bamforth, Michael A. Walter

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Medical Genetics · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic and Clinical Aspects of Sex Determination and Chromosomal Abnormalities
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésFrameshift mutationSOX9GeneticsTestis determining factorBiologySex reversalMutationMolecular biologyGeneTranscription factorY chromosome

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Campomelic dysplasia (CD) is a sporadic autosomal dominant syndrome that results in skeletal malformation and developmental abnormalities. Death usually occurs neonatally as a result of respiratory insufficiencies, but life expectancy varies depending on the severity of the phenotype. XY sex reversal is common in CD, and a range of genital defects is observed in males and females. CD is due to mutations in SOX9, a member of the SOX (SRY-related HMG box) gene family. SOX9 is a transcription factor involved in chondrogenesis and sex determination. We present a CD patient with a normal 46,XX karyotype and female phenotype. Single-stranded conformation polymorphism analysis of DNA from this CD patient demonstrated a single-stranded conformation polymorphism shift in the C-terminal region of SOX9. DNA sequencing showed a frameshift mutation resulting from the insertion of a single guanine residue in nucleotide region 1,453-1,456. This insertion mutation creates a mutant SOX9 open reading frame that is 201 nucleotides longer than the normal gene. It has been shown that the C-terminal region of SOX9 is responsible for the transactivating ability of the protein. The frameshift identified here affects approximately half of the protein region needed for full transactivating function. We hypothesize that residual SOX9 function may explain why this patient survived infancy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,427
Score d'incertitude au seuil0,511

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,306
Écart entre enseignants0,295 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations36
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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