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Enregistrement W2071729381 · doi:10.1111/jam.12088

Isolation and characterization of indigenous endophytic bacteria associated with leaves of switchgrass (<i>Panicum virgatum </i>L.) cultivars

2012· article· en· W2071729381 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueJournal of Applied Microbiology · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant-Microbe Interactions and Immunity
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésPanicum virgatumCultivarBiologyIsolation (microbiology)BotanyBacteriaPanicumIndigenousBiotechnologyBioenergyEcologyMicrobiologyBiofuel

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

AIMS: To isolate and characterize indigenous bacterial endophytes from cultivars of switchgrass and study their antimicrobial and growth promoting potential. METHODS AND RESULTS: The diversity, molecular and biochemical characterizations of indigenous and culturable bacterial endophytes residing in leaves of switchgrass have not been studied previously. This study describes the characterization of 31 bacterial endophytes from three switchgrass cutlivars: Cave-in Rock, Blue Jacket and Tecumseh. Molecular and phylogenetic analysis based on the 16S rRNA sequence grouped the endophytes into eight different taxa that shared high homology of 98-99% with other known sequences. Bacterial endophytes were identified as Microbacterium testaceum, Curtobacterium flaccumfaciens, Bacillus subtilis and Bacillus pumilus, Pseudomonas fluorescens, Sphingomonas parapaucimobilis, Serratia sp. and Pantoea ananatis. Some endophytes were detected in switchgrass seeds and in plants that originated from seeds collected a year earlier, confirming vertical transmission to the next generation of the host. Selected endophytes produced cellulases and were capable of solubilizing inorganic phosphorus. Analysis of cell-free culture filtrate of selected strains using direct infusion orbitrap mass spectrometry confirmed the presence of several well-characterized lipopeptide toxins and phytohormones. Re-inoculation of the roots of switchgrass seedlings with endophytes singly or combined confirmed their migration to the upper aerial parts of the plant. CONCLUSIONS: Our findings suggest that switchgrass leaves harbour a diversity of bacterial endophytes, some of which could potentially be applied as growth promoting bacteria. SIGNIFICANCE AND IMPACT OF THE STUDY: This is the first report on the characterization of indigenous bacterial endophytes and their potential use as biofertilizers.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,459
Score d'incertitude au seuil0,174

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,187
Écart entre enseignants0,179 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle