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Enregistrement W2071731903 · doi:10.1095/biolreprod.103.021709

Gene Expression Profiling of Differentially Expressed Genes in Granulosa Cells of Bovine Dominant Follicles Using Suppression Subtractive Hybridization1

2004· article· en· W2071731903 sur OpenAlexaff
Tania Fayad, Valérie Lévesque, Jean Sirois, David W. Silversides, Jacques G. Lussier

Notice bibliographique

RevueBiology of Reproduction · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueReproductive Biology and Fertility
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologySuppression subtractive hybridizationFollicular phaseAntral follicleGeneCorpus luteumGene expressionAndrologyFollicleEstrous cycleGene expression profilingComplementary DNAOvarian follicleMolecular biologyGeneticscDNA libraryEndocrinologyOvary

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Development of antral follicles beyond 3 to 4 mm in cattle appears as a wave pattern that occurs two to three times during the estrous cycle. Each wave presents a cyclic recruitment of multiple follicles at the 3- to 4-mm stage, followed by the selection of a single follicle that becomes the dominant follicle (DF). The molecular determinants involved in the follicular dominance process remain poorly understood. The objective of the current study was to compare gene expression in granulosa cells (GCs) between growing dominant follicles from Day 5 of the estrous cycle and nonselected small follicles (<or=4 mm) using the suppression subtractive hybridization (SSH) approach to identify candidate genes differentially expressed in GCs of the DF. Small follicle cDNAs were subtracted from DF cDNAs (DF-SF) and used to establish a DF GC-subtracted cDNA library. A total of 42 nonredundant cDNAs were identified. Detection of previously identified genes such as CX43, CYP19, INHBA, and SERPINE2 supported the validity of our experimental model and the use of SSH as the method of analysis. For selected genes such as ApoER2, CPD, CSPG2, 14-3-3 epsilon, NR5A2/SF2, RGN/SMP30, and SERPINE2, gene expression profiles were compared by virtual Northern blot or reverse transcriptase-polymerase chain reaction, and results confirmed an increase or induction of their mRNA in GCs of dominant follicles compared with that of small follicles. We conclude that we have identified novel genes (known and unknown) that are up-regulated in bovine GCs that may affect follicular growth, dominance, or both.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,057
Score d'incertitude au seuil0,545

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,292
Écart entre enseignants0,264 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations81
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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