Gene Expression Profiling of Differentially Expressed Genes in Granulosa Cells of Bovine Dominant Follicles Using Suppression Subtractive Hybridization1
Notice bibliographique
Résumé
Development of antral follicles beyond 3 to 4 mm in cattle appears as a wave pattern that occurs two to three times during the estrous cycle. Each wave presents a cyclic recruitment of multiple follicles at the 3- to 4-mm stage, followed by the selection of a single follicle that becomes the dominant follicle (DF). The molecular determinants involved in the follicular dominance process remain poorly understood. The objective of the current study was to compare gene expression in granulosa cells (GCs) between growing dominant follicles from Day 5 of the estrous cycle and nonselected small follicles (≤4 mm) using the suppression subtractive hybridization (SSH) approach to identify candidate genes differentially expressed in GCs of the DF. Small follicle cDNAs were subtracted from DF cDNAs (DF-SF) and used to establish a DF GC-subtracted cDNA library. A total of 42 nonredundant cDNAs were identified. Detection of previously identified genes such as CX43, CYP19, INHBA, and SERPINE2 supported the validity of our experimental model and the use of SSH as the method of analysis. For selected genes such as ApoER2, CPD, CSPG2, 14-3-3 epsilon, NR5A2/SF2, RGN/SMP30, and SERPINE2, gene expression profiles were compared by virtual Northern blot or reverse transcriptase-polymerase chain reaction, and results confirmed an increase or induction of their mRNA in GCs of dominant follicles compared with that of small follicles. We conclude that we have identified novel genes (known and unknown) that are up-regulated in bovine GCs that may affect follicular growth, dominance, or both.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».