Identification of sequence, protein isoforms, and distribution of the hyaluronan‐binding protein RHAMM in adult and developing rat brain
Notice bibliographique
Résumé
The protein RHAMM (for "receptor for hyaluronan-mediated motility"; CD168) is a member of the hyaladherin family of hyaluronan-binding proteins. RHAMM has a role in cell signaling, migration, and adhesion via interactions with hyaluronan, microtubules, actin, calmodulin, and components of the extracellular regulated kinase (erk) signaling pathway. Based on previous findings of potentially similar roles in neural cells in culture, we investigated the molecular characteristics, protein expression profile, and distribution of RHAMM in rat brain. Reverse transcriptase-polymerase chain reaction (RT-PCR) using RNA isolated from adult rat brain yielded a single RHAMM sequence of 2.1 kilobases encoding a protein of 82.4 kDa. RHAMM is subject to alternate splicing in other systems, but no RT-PCR evidence was found for splice variants in brain, although our analysis does not rule out this possibility. The amino acid sequence displayed homology with human and murine RHAMM (74% and 80%, respectively) but contained only one copy of a 21-amino-acid sequence that is repeated five times in the murine homologue. By using anti-RHAMM antibodies, several RHAMM isoforms were identified in brain. Immunohistochemically, RHAMM was found in the vast majority of neurons and in many oligodendrocytes throughout brain, with heterogeneous levels among cell populations, and was confined to the somata and initial processes of these cells. RHAMM was detected in neurons of cerebral cortex and most subcortical and brainstem structures at postnatal day 1 and exhibited an adult distribution pattern by postnatal day 5. High levels were detected in oligodendrocytes by postnatal day 10. The widespread expression of RHAMM in adult and developing brain implies a role for this protein and its ligand hyaluronan in key events of cell signaling and cytoskeletal regulation in the CNS.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».