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Enregistrement W2071821511 · doi:10.1523/jneurosci.3222-07.2008

An Aggregate-Inducing Peripherin Isoform Generated through Intron Retention Is Upregulated in Amyotrophic Lateral Sclerosis and Associated with Disease Pathology

2008· article· en· W2071821511 sur OpenAlexafffund
Shangxi Xiao, Sonja Tjostheim, Teresa Sanelli, Jesse R. McLean, Patrick Horne, Yuxin Fan, John Ravits, Michael J. Strong, Janice Robertson

Notice bibliographique

RevueJournal of Neuroscience · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAmyotrophic Lateral Sclerosis Research
Établissements canadiensWestern UniversityOccupational Cancer Research CentreUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeCanadian Institutes of Health ResearchALS Society of CanadaALS AssociationMotor Neurone Disease AssociationMuscular Dystrophy AssociationNational Institutes of Health
Mots-clésPeripherinAmyotrophic lateral sclerosisBiologyRNA splicingGene isoformMotor neuronIntronAlternative splicingMolecular biologyCell biologyPathologyGeneticsGeneNeuroscienceSpinal cordMedicineRNADisease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The neuronal intermediate filament protein peripherin is a component of ubiquitinated inclusions and of axonal spheroids in amyotrophic lateral sclerosis (ALS). Overexpression of peripherin causes motor neuron degeneration in transgenic mice and variations within the peripherin gene have been identified in ALS cases. We have shown previously the abnormal expression of a neurotoxic peripherin splice variant in transgenic mice expressing mutant superoxide dismutase-1. These findings indicated that abnormalities of peripherin splicing may occur in ALS. In the current study, peripherin splice variants were identified by reverse transcription-PCR of human neuronal RNA and comparisons in expression made between control and ALS spinal cord using Western blot analysis and immunocytochemistry. Using this approach we have identified a novel peripherin transcript retaining introns 3 and 4 that results in a 28 kDa splice isoform, designated Per 28. Using an antibody specific to Per 28, we show that this isoform is expressed at low stoichiometric levels from the peripherin gene, however causes peripherin aggregation when its expression is upregulated. Importantly we show an upregulation of Per 28 expression in ALS compared with controls, at both the mRNA and protein levels, and that Per 28 is associated with disease pathology, specifically round inclusions. These findings are the first to establish that peripherin splicing abnormalities occur in ALS, generating aggregation-prone splice isoforms.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,892
Score d'incertitude au seuil0,590

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,062
Tête enseignante GPT0,290
Écart entre enseignants0,228 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations71
Publié2008
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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