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Enregistrement W2071855331 · doi:10.1074/jbc.m301681200

Molecular and Biochemical Characterization of an Enzyme Responsible for the Formation of Hypericin in St. John's Wort (Hypericum perforatum L.)

2003· article· en· W2071855331 sur OpenAlexaboutno aff
Harsh P. Bais, Ramarao Vepachedu, Christopher B. Lawrence, Frank R. Stermitz, Jorge M. Vivanco

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueNatural Compound Pharmacology Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHypericinHypericum perforatumEmodinComplementary DNAMolecular biologycDNA libraryBiochemistryGeneChemistryBiologyPharmacology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A major gene termed Hyp-1 encoding for hypericin (HyH) biosynthesis was cloned and characterized from Hypericum perforatum (St. John's wort) cell cultures. H. perforatum leaves are widely used as an herbal remedy in the treatment of mild to moderate depression. Hypericin, a photosensitive and red-colored naphthodianthrone, has been reported as the bioactive compound responsible for reversing the depression symptoms. In this study a novel red-color-based colony screening method for examining a cDNA library (lambda-TriplEX2) derived from H. perforatum cell cultures revealed the gene responsible for hypericin biosynthesis after the administration of emodin, a precursor of hypericin. The selected clones were expressed in Escherichia coli (BM 25.8 line) and were further screened for biosynthesis of emodin to hypericin, which resulted in an 84.6% conversion. The full-length cDNA sequence of Hyp-1 is 782 nucleotides in length with an open reading frame of 477 nucleotides coding for a protein of 159 amino acids, with a 45.1% homology to Bet.v.1 class allergens. Reverse transcriptase-PCR analysis showed high levels of Hyp-1 transcripts in dark-grown cell cultures compared with the levels in light-grown cell cultures and leaves. Southern blot analysis showed the presence of a single Hyp-1 gene in H. perforatum. Furthermore, Hyp-1 was expressed with a His6 affinity tag linked to its N terminal region using the expression vector pET-28a, and the recombinant Hyp-1 protein was able to convert HyH from emodin under in vitro conditions. HyH product inhibition was observed with emodin analogues, rhein, rhein methyl ester, and DNA3-55-1. Our results demonstrate a direct and complex conversion of emodin to HyH that is solely catalyzed by Hyp-1, a Bet.v.1 class allergen from H. perforatum.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,252
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations132
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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