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Enregistrement W2071859231 · doi:10.1111/j.1751-1097.2009.00559.x

Does the DNA Binding Mode of a Molecule Affect its Ability to Interact With Singlet Oxygen?

2009· article· en· W2071859231 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevuePhotochemistry and Photobiology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueOrganic Chemistry Cycloaddition Reactions
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSinglet oxygenAffect (linguistics)DNAMoleculeChemistryBiophysicsMode (computer interface)OxygenBiologyBiochemistryPsychologyCommunicationComputer scienceHuman–computer interaction

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Singlet oxygen is known to be a potent mutagenic agent and several biologically relevant molecules have been proposed to act as scavengers for this noxious species. However, numerous studies have been conducted in homogenous solution and the reactivity of singlet oxygen scavengers known to bind DNA has never been investigated in double-stranded DNA. In the following paper, we present the results obtained regarding the interaction between 4',6-diamidino-2-phenylindole (DAPI) and singlet oxygen. We show the molecule to be a potent scavenger of singlet oxygen in aqueous solution with an absolute rate constant (chemical and physical quenching of singlet oxygen) of (1.7+/-0.3)x10(7) m(-1) s(-1). In addition, we demonstrate that the binding mode of a singlet oxygen scavenger to DNA can strongly influence its reactivity toward singlet oxygen. In the case of DAPI, while the molecule exhibits a chemical reaction with singlet oxygen when the molecule is free in aqueous solution or intercalated in GC sequences of DNA, DAPI becomes chemically unreactive toward singlet oxygen when bound in the minor groove of DNA AT sequences.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,250
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle