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Enregistrement W2072026981 · doi:10.1371/journal.pmed.1000022

STrengthening the REporting of Genetic Association Studies (STREGA)— An Extension of the STROBE Statement

2009· article· en· W2072026981 sur OpenAlexafffund
Julian Little, Julian P. T. Higgins, John P. A. Ioannidis, David Moher, France Gagnon, Erik von Elm, Muin J. Khoury, Barbara Cohen, Jeremy Grimshaw, Paul Scheet, Marta Gwinn, Robin E. Williamson, Guangyong Zou, Kim Hutchings, Candice Y. Johnson, Valerie Tait, Miriam Wiens, Jean Golding, Cornelia M. van Duijn, John McLaughlin, Andrew D. Paterson, George A. Wells, Isabel Fortier, Matthew L. Freedman, Maja Zečević, Richard King, Claire Infante‐Rivard, Alexandre F.R. Stewart, Nick Birkett

Notice bibliographique

RevuePLoS Medicine · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Associations and Epidemiology
Établissements canadiensCancer Care OntarioOccupational Cancer Research CentreLunenfeld-Tanenbaum Research InstitutePublic Health OntarioOntario Institute for Cancer ResearchMcGill University and Génome Québec Innovation CentreRobarts Clinical TrialsSickKids FoundationUniversity of TorontoWestern UniversityGenome CanadaMcGill UniversityUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesDNA GenotekGenome Canada
Mots-clésStrengthening the reporting of observational studies in epidemiologyPopulation stratificationChecklistObservational studyGenetic associationPopulationMEDLINEGenetic epidemiologyPsychologyMedicineBiologyGeneticsSingle-nucleotide polymorphismEnvironmental healthPathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Making sense of rapidly evolving evidence on genetic associations is crucial to making genuine advances in human genomics and the eventual integration of this information in the practice of medicine and public health. Assessment of the strengths and weaknesses of this evidence, and hence the ability to synthesize it, has been limited by inadequate reporting of results. The STrengthening the REporting of Genetic Association studies (STREGA) initiative builds on the Strengthening the Reporting of Observational Studies in Epidemiology (STROBE) Statement and provides additions to 12 of the 22 items on the STROBE checklist. The additions concern population stratification, genotyping errors, modelling haplotype variation, Hardy-Weinberg equilibrium, replication, selection of participants, rationale for choice of genes and variants, treatment effects in studying quantitative traits, statistical methods, relatedness, reporting of descriptive and outcome data, and the volume of data issues that are important to consider in genetic association studies. The STREGA recommendations do not prescribe or dictate how a genetic association study should be designed but seek to enhance the transparency of its reporting, regardless of choices made during design, conduct, or analysis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,868
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,916
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesMétarecherche
DomaineSignal candidat: Présentation des résultats · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,132
Score d'incertitude au seuil0,163

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,8680,916
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0040,007
Méta-épidémiologie (sens large)0,0090,017
Bibliométrie0,0180,023
Études des sciences et des technologies0,0050,018
Communication savante0,0150,016
Science ouverte0,0140,041
Intégrité de la recherche0,0300,030
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,006

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,055
Tête enseignante GPT0,342
Écart entre enseignants0,288 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; l’étiquette directe de Gemma et le classifieur distillé Codex s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeSans objet
DomainePrésentation des résultats
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations783
Publié2009
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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