MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2072054358 · doi:10.1111/j.1365-313x.2008.03425.x

A high‐throughput chemical screen for resistance to <i>Pseudomonas syringae</i> in Arabidopsis

2008· article· en· W2072054358 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueThe Plant Journal · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Pathogenic Bacteria Studies
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesUniversity of North Carolina at Chapel HillUniversity of TorontoNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanada Research Chairs
Mots-clésPseudomonas syringaeArabidopsisArabidopsis thalianaPathosystemVirulenceBiologySalicylic acidMicrobiologyHigh-throughput screeningPhytoalexinFlagellinPathogenBacteriaGeneMutantBiochemistryGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The study of plant pathogenesis and the development of effective treatments to protect plants from diseases could be greatly facilitated by a high-throughput pathosystem to evaluate small-molecule libraries for inhibitors of pathogen virulence. The interaction between the Gram-negative bacterium Pseudomonas syringae and Arabidopsis thaliana is a model for plant pathogenesis. However, a robust high-throughput assay to score the outcome of this interaction is currently lacking. We demonstrate that Arabidopsis seedlings incubated with P. syringae in liquid culture display a macroscopically visible 'bleaching' symptom within 5 days of infection. Bleaching is associated with a loss of chlorophyll from cotyledonary tissues, and is correlated with bacterial virulence. Gene-for-gene resistance is absent in the liquid environment, possibly because of the suppression of the hypersensitive response under these conditions. Importantly, bleaching can be prevented by treating seedlings with known inducers of plant defence, such as salicylic acid (SA) or a basal defence-inducing peptide of bacterial flagellin (flg22) prior to inoculation. Based on these observations, we have devised a high-throughput liquid assay using standard 96-well plates to investigate the P. syringae-Arabidopsis interaction. An initial screen of small molecules active on Arabidopsis revealed a family of sulfanilamide compounds that afford protection against the bleaching symptom. The most active compound, sulfamethoxazole, also reduced in planta bacterial growth when applied to mature soil-grown plants. The whole-organism liquid assay provides a novel approach to probe chemical libraries in a high-throughput manner for compounds that reduce bacterial virulence in plants.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,858
Score d'incertitude au seuil0,290

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,211
Écart entre enseignants0,173 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle