Differential Splicing Alters Subcellular Localization of the Alpha but not Beta Isoform of the MIER1 Transcriptional Regulator in Breast Cancer Cells
Notice bibliographique
Résumé
MIER1 was originally identified in a screen for novel fibroblast growth factor activated early response genes. The mier1 gene gives rise to multiple transcripts encoding protein isoforms that differ in their amino (N-) and carboxy (C-) termini. Much of the work to date has focused on the two C-terminal variants, MIER1α and β, both of which have been shown to function as transcriptional repressors. Our previous work revealed a dramatic shift in MIER1α subcellular localization from nuclear in normal breast tissue to cytoplasmic in invasive breast carcinoma, suggesting that loss of nuclear MIER1α may play a role in breast cancer development. In the present study, we investigated whether alternative splicing to include a cassette exon and produce an N-terminal variant of MIER1α affects its subcellular localization in MCF7 breast carcinoma cells. We demonstrate that this cassette exon, exon 3A, encodes a consensus leucine-rich nuclear export signal (NES). Inclusion of this exon in MIER1α to produce the MIER1-3Aα isoform altered its subcellular distribution in MCF7 cells from 81% nuclear to 2% nuclear and this change in localization was abrogated by mutation of critical leucines within the NES. Treatment with leptomycin B (LMB), an inhibitor of the nuclear export receptor CRM1, resulted in a significant increase in the percentage of cells with nuclear MIER1-3Aα, from 4% to 53%, demonstrating that cytoplasmic localization of this isoform was due to CRM1-dependent nuclear export. Inclusion of exon 3A in MIER1β to produce the N-terminal variant MIER1-3Aβ however had little effect on the nuclear targeting of this isoform. Our results demonstrate that alternative splicing to include exon 3A specifically affects the localization pattern of the α isoform.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».