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Enregistrement W2072232275 · doi:10.1091/mbc.e06-10-0950

A Cytosolic Splice Variant of Cab45 Interacts with Munc18b and Impacts on Amylase Secretion by Pancreatic Acini

2007· article· en· W2072232275 sur OpenAlexafffund
Patrick Lam, Kati Hyvärinen, Maria Kauppi, Laura Iris Cosen-Binker, Saara Laitinen, Sirkka Keränen, Herbert Y. Gaisano, Vesa M. Olkkonen

Notice bibliographique

RevueMolecular Biology of the Cell · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCellular transport and secretion
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Institute on Alcohol Abuse and AlcoholismUniversity of TorontoNational Institutes of HealthSuomen KulttuurirahastoBanting and Best Diabetes Centre, University of TorontoAcademy of Finland
Mots-clésBiologyExocytosisSyntaxinSecretionCell biologyCytosolGene isoformMolecular biologyBiochemistryEnzymeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We identified in a yeast two-hybrid screen the EF-hand Ca(2+)-binding protein Cab45 as an interaction partner of Munc18b. Although the full-length Cab45 resides in Golgi lumen, we characterize a cytosolic splice variant, Cab45b, expressed in pancreatic acini. Cab45b is shown to bind (45)Ca(2+), and, of its three EF-hand motifs, EF-hand 2 is demonstrated to be crucial for the ion binding. Cab45b is shown to interact with Munc18b in an in vitro assay, and this interaction is enhanced in the presence of Ca(2+). In this assay, Cab45b also binds the Munc18a isoform in a Ca(2+)-dependent manner. The endogenous Cab45b in rat acini coimmunoprecipitates with Munc18b, syntaxin 2, and syntaxin 3, soluble N-ethylmaleimide-sensitive factor attachment protein receptors with key roles in the Ca(2+)-triggered zymogen secretion. Furthermore, we show that Munc18b bound to syntaxin 3 recruits Cab45b onto the plasma membrane. Importantly, antibodies against Cab45b are shown to inhibit in a specific and dose-dependent manner the Ca(2+)-induced amylase release from streptolysin-O-permeabilized acini. The present study identifies Cab45b as a novel protein factor involved in the exocytosis of zymogens by pancreatic acini.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,003
Tête enseignante GPT0,213
Écart entre enseignants0,209 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations34
Publié2007
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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