Crystallogenesis of Steroid-Converting Enzymes and Their Complexes: Enzyme–Ligand Interaction Studies and Inhibitor Design Facilitated by Complex Structures
Notice bibliographique
Résumé
Crystal growth of steroid enzymes in complex with hydrophobic ligands is hindered by the low solubility of both partners. However, their interaction can promote highly soluble complexes, leading to well diffracting crystals and high-quality structures. The moderate amphiphilic property of polyethylene glycol increases steroid solubility and facilitates complex formation, but altered orders of soaking can lead to a variety of complex formations and different structures. Understanding the latter mechanism is important for inhibitor design. Thus, different enzyme–ligand complex structures have provided detailed pictures of steroid alternative binding and multispecificity of the enzymes, as, for example, in the case of human 17β-hydroxysteroid dehydrogenases (17β-HSD) type 1 due to C19 steroid pseudosymmetry or in human 17β-HSD type 5 due to the spatial binding site. These complex structures also provide insights into the dynamics of the enzyme binding and catalytic process. Hybrid inhibitors constituted by the steroid and adenine cores of the native substrate and cofactor can properly occupy their original binding sites in 17β-HSD1, leading to an inhibition constant at the nanomolar level. Altered complex crystallization and even a modified order of soaking may result in different complex structures, shedding light on detailed protein–ligand interactions as well as on the enzyme reaction mechanism. These results highlight the important contribution and high significance of the crystal growth mechanism to protein structure determination and function study, as well as to drug design for medicinal applications.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».