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Enregistrement W2072243132 · doi:10.1021/cg700709k

Crystallogenesis of Steroid-Converting Enzymes and Their Complexes: Enzyme–Ligand Interaction Studies and Inhibitor Design Facilitated by Complex Structures

2007· article· en· W2072243132 sur OpenAlex
Mausumi Mazumdar, Ming Zhou, Dao‐Wei Zhu, Arezki Azzi, Sheng‐Xiang Lin

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueCrystal Growth & Design · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueSteroid Chemistry and Biochemistry
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSteroidChemistryLigand (biochemistry)EnzymeStereochemistrySolubilityCofactorBinding siteActive siteSubstrate (aquarium)Combinatorial chemistryBiochemistryReceptorOrganic chemistryBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Crystal growth of steroid enzymes in complex with hydrophobic ligands is hindered by the low solubility of both partners. However, their interaction can promote highly soluble complexes, leading to well diffracting crystals and high-quality structures. The moderate amphiphilic property of polyethylene glycol increases steroid solubility and facilitates complex formation, but altered orders of soaking can lead to a variety of complex formations and different structures. Understanding the latter mechanism is important for inhibitor design. Thus, different enzyme–ligand complex structures have provided detailed pictures of steroid alternative binding and multispecificity of the enzymes, as, for example, in the case of human 17β-hydroxysteroid dehydrogenases (17β-HSD) type 1 due to C19 steroid pseudosymmetry or in human 17β-HSD type 5 due to the spatial binding site. These complex structures also provide insights into the dynamics of the enzyme binding and catalytic process. Hybrid inhibitors constituted by the steroid and adenine cores of the native substrate and cofactor can properly occupy their original binding sites in 17β-HSD1, leading to an inhibition constant at the nanomolar level. Altered complex crystallization and even a modified order of soaking may result in different complex structures, shedding light on detailed protein–ligand interactions as well as on the enzyme reaction mechanism. These results highlight the important contribution and high significance of the crystal growth mechanism to protein structure determination and function study, as well as to drug design for medicinal applications.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,061
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,037
Tête enseignante GPT0,272
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle