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Enregistrement W2072393958 · doi:10.1002/humu.10069

GeneTests-GeneClinics: Genetic testing information for a growing audience

2002· article· en· W2072393958 sur OpenAlexaff
Roberta A Pagon, Peter Tarczy‐Hornoch, Patricia K. Baskin, J Edwards, Maxine L. Covington, Miriam Espeseth, Christine Beahler, Thomas D. Bird, Bradley W. Popovich, Charli Nesbitt, Cynthia R. Dolan, Kathi Marymee, Nancy Hanson, Whitney Neufeld‐Kaiser, Gina McCullough Grohs, Tracy Kicklighter, Cynthia Abair, Audin Malmin, Matthew Barclay, Rajasri Dharani Palepu

Notice bibliographique

RevueHuman Mutation · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBRCA gene mutations in cancer
Établissements canadiensXenon Pharmaceuticals (Canada)
Organismes subventionnairesU.S. National Library of Medicine
Mots-clésBiologyGenetic testingGeneticsComputational biologyEvolutionary biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The development and usage of two companion NIH-funded genetic testing information databases, GeneTests (www.genetests.org) and GeneClinics (www.geneclinics.org), now merged into one web site, reflect the steadily increasing use of genetic testing and the expanding audience for genetic testing information. Established in 1993 as Helix, a genetics laboratory directory of approximately 110 listings, GeneTests has grown into a database of over 900 tests for inherited diseases, a directory of over 500 international laboratories, a directory of over 1,000 U.S. and international genetics clinics, and a resource for educational/teaching materials and reports of summary genetic test data. GeneClinics, founded in 1997 as an expert-authored, peer-reviewed, disease-specific knowledge base relating genetic testing to patient care, has grown steadily, now containing over 130 expert-authored, peer-reviewed full-text entries relating genetic testing information to diagnosis, management, and genetic counseling of specific inherited diseases. In spring 2001 the two databases were merged and in October 2001 the two web sites were merged for the purpose of seamless navigation into the GeneTests-GeneClinics site (www.genetests.org or www.geneclinics.org); the GeneClinics knowledge base was renamed "GeneReviews" to avoid confusion with the U.S. and international clinic directories. As genetic testing has moved steadily out of research venues and into routine medical practice, the user audience for these databases has become international and expansive and includes healthcare providers, patients, educators, policy makers, and the media. The use of these combined resources has grown to approximately 3,200 visits/day.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,017
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: Autre
Score de désaccord entre enseignants0,168
Score d'incertitude au seuil0,562

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,017
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0050,007
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0050,005
Science ouverte0,0020,005
Intégrité de la recherche0,0030,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,1680,155

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,046
Tête enseignante GPT0,299
Écart entre enseignants0,253 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations83
Publié2002
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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