MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2072419481 · doi:10.4161/epi.5.6.12224

Interplay of bromodomain and histone acetylation in the regulation of p300-dependent genes

2010· article· en· W2072419481 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueEpigenetics · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein Degradation and Inhibitors
Établissements canadiensUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésBromodomainBiologyAcetylationHDAC4HistoneHistone acetyltransferasePCAFHistone deacetylaseP300-CBP Transcription FactorsHistone codeCoactivatorSAP30HDAC8Regulation of gene expressionChromatin remodelingChromatinHistone deacetylase 5GeneticsHDAC11Histone H4NucleosomeTranscription factorGeneHistone Acetyltransferases

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The bromodomain is an evolutionarily conserved motif found in many transcriptional activators including p300 which contains an intrinsic histone acetyltransferase activity and is a general coactivator for many transcription factors. One mode of bromodomain action is to serve as a binding module to recognize specific acetyl-lysine residue of histones during chromatin remodeling and transcriptional activation. The function of p300 is required for diverse sets of gene expression. However, it is not known whether the p300 bromodomain is involved in the expression of all or only subset of p300-dependent genes. In this study, we examined the impact of either wild type or a bromo-deficient p300 on the expression of several p300-dependant genes. The effects of histone acetylation on the expression of these genes were also assessed by targeting histone deacetylase activities with an inhibitor approach. We show that the impact of these inhibitors on the transcriptional activation of p300-dependent genes are impaired in cells containing the bromo-deficient p300, indicating that the interplay of p300 and histone acetylation in p300-dependent gene transcription requires the bromodomain. We also observed an increase in the expression of bromo-deficient p300 at the level of transcription possibly to compensate for the loss of p300 function. However, the high level of bromo-deficient p300 is not able to maintain the basal level of histone acetylation. Thus, the bromodomain is important for p300 to maintain the basal level of histone acetylation and to induce the transcriptional activation of p300-dependent genes. Nevertheless, the requirement of bromodomain and histone acetylation in p300-dependent gene transcription is determined by a gene specific manner.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,067
Score d'incertitude au seuil0,185

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,263
Écart entre enseignants0,257 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle