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Enregistrement W2072427493 · doi:10.4161/chan.5.6.17484

Measurement of the membrane potential in small cells using patch clamp methods

2011· article· en· W2072427493 sur OpenAlexafffund
James R. Wilson, Robert B. Clark, Umberto Banderali, Wayne R. Giles

Notice bibliographique

RevueChannels · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon channel regulation and function
Établissements canadiensAlberta Bible CollegeUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesFondation pour la Recherche MédicaleCanadian Institutes of Health ResearchAlberta Innovates - Health SolutionsHeart and Stroke Foundation of Canada
Mots-clésPatch clampClampMembraneChemistryMembrane potentialBiophysicsCurrent clampElectrophysiologyBiologyComputer scienceBiochemistryNeuroscienceClamping

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The resting membrane potential, E(m), of mammalian cells is a fundamental physiological parameter. Even small changes in E(m) can modulate excitability, contractility and rates of cell migration. At present accurate, reproducible measurements of E(m) and determination of its ionic basis remain significant challenges when patch clamp methods are applied to small cells. In this study, a mathematical model has been developed which incorporates many of the main biophysical principles which govern recordings of the resting potential of 'small cells'. Such a prototypical cell (approx. capacitance, 6 pF; input resistance 5 GΩ) is representative of neonatal cardiac myocytes, and other cells in the cardiovascular system (endothelium, fibroblasts) and small cells in other tissues, e.g. bone (osteoclasts) articular joints (chondrocytes) and the pancreas (β cells). Two common experimental conditions have been examined: (1) when the background K(+) conductance is linear; and (2) when this K(+) conductance is highly nonlinear and shows pronounced inward rectification. In the case of a linear K(+) conductance, the presence of a "leakage" current through the seal resistance between the cell membrane and the patch pipette always depolarizes E(m). Our calculations confirm that accurate characterization of E(m) is possible when the seal resistance is at least 5 times larger than the input resistance of the targeted cell. Measurement of E(m) under conditions in which the main background current includes a markedly nonlinear K(+) conductance (due to inward rectification) yields complex and somewhat counter-intuitive findings. In fact, there are at least two possible stable values of resting membrane potential for a cell when the nonlinear, inwardly rectifying K(+) conductance interacts with the seal current. This type of bistable behavior has been reported in a variety of small mammalian cells, including those from the heart, endothelium, smooth muscle and bone. Our theoretical treatment of these two common experimental situations provides useful mechanistic insights, and suggests practical methods by which these significant limitations, and their impact, can be minimized.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,002
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,082
Tête enseignante GPT0,280
Écart entre enseignants0,198 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations47
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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