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Enregistrement W2072523791 · doi:10.1111/j.1462-5822.2009.01421.x

The innate immune molecule, NOD1, regulates direct killing of<i>Helicobacter pylori</i>by antimicrobial peptides

2009· article· en· W2072523791 sur OpenAlexfundno aff
Alexandra Grubman, Maria Kaparakis‐Liaskos, Jérôme Viala, Cody C. Allison, Luminita Badea, Abdulgader Karrar, Ivo G. Boneca, Lionel Le Bourhis, Shane Reeve, A. Ian Smith, Elizabeth L. Hartland, Dana J. Philpott, Richard L. Ferrero

Notice bibliographique

RevueCellular Microbiology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHelicobacter pylori-related gastroenterology studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchHoward Hughes Medical Institute
Mots-clésNOD1BiologyInnate immune systemPeptidoglycanHelicobacter pyloriMicrobiologyGene knockdownImmune systemPathogenicity islandHEK 293 cellsBeta defensinBacteriaCell cultureNOD2ImmunologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The cytosolic innate immune molecule, NOD1, recognizes peptidoglycan (PG) delivered to epithelial cells via the Helicobacter pylori cag pathogenicity island (cagPAI), and has been implicated in host defence against cagPAI(+)H. pylori bacteria. To further clarify the role of NOD1 in host defence, we investigated NOD1-dependent regulation of human beta-defensins (DEFBs) in two epithelial cell lines. Our findings identify that NOD1 activation, via either cagPAI(+) bacteria or internalized PG, was required for DEFB4 and DEFB103 expression in HEK293 cells. To investigate cell type-specific induction of DEFB4 and DEFB103, we generated stable NOD1'knockdown' (KD) and control AGS cells. Reporter gene assay and RT-PCR analyses revealed that only DEFB4 was induced in an NOD1-/cagPAI-dependent fashion in AGS cells. Moreover, culture supernatants from AGS control, but not AGS NOD1 KD cells, stimulated with cagPAI(+)H. pylori, significantly reduced H. pylori bacterial numbers. siRNA studies confirmed that human beta-defensin 2 (hBD-2), but not hBD-3, contributes to the antimicrobial activity of AGS cell supernatants against H. pylori. This study demonstrates, for the first time, the involvement of NOD1 and hBD-2 in direct killing of H. pylori bacteria by epithelial cells and confirms the importance of NOD1 in host defence mechanisms against cagPAI(+)H. pylori infection.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,213
Écart entre enseignants0,206 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations120
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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