Differentiation stage–specific expression of microRNAs in B lymphocytes and diffuse large B-cell lymphomas
Notice bibliographique
Résumé
miRNAs are small RNA molecules binding to partially complementary sites in the 3'-UTR of target transcripts and repressing their expression. miRNAs orchestrate multiple cellular functions and play critical roles in cell differentiation and cancer development. We analyzed miRNA profiles in B-cell subsets during peripheral B-cell differentiation as well as in diffuse large B-cell lymphoma (DLBCL) cells. Our results show temporal changes in the miRNA expression during B-cell differentiation with a highly unique miRNA profile in germinal center (GC) lymphocytes. We provide experimental evidence that these changes may be physiologically relevant by demonstrating that GC-enriched hsa-miR-125b down-regulates the expression of IRF4 and PRDM1/BLIMP1, and memory B cell-enriched hsa-miR-223 down-regulates the expression of LMO2. We further demonstrate that although an important component of the biology of a malignant cell is inherited from its nontransformed cellular progenitor-GC centroblasts-aberrant miRNA expression is acquired upon cell transformation. A 9-miRNA signature was identified that could precisely differentiate the 2 major subtypes of DLBCL. Finally, expression of some of the miRNAs in this signature is correlated with clinical outcome of uniformly treated DLBCL patients.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».