Identification and Characterization of a Novel Gene, dapr, Involved in Skeletal Muscle Differentiation and Protein Kinase B Signaling
Notice bibliographique
Résumé
The phosphatidylinositol 3-kinase (PI3K) signaling pathway has been associated with a variety of cellular functions ranging from cell cycle regulation to tissue development. Although years of research have extensively characterized this signaling pathway, little is known as to how specific cellular events are coordinated by its activation. Here we demonstrate that Dapr (differentiation-associated protein), a novel protein, appears to focus one aspect of this pathway by acting as a putative scaffold protein during skeletal muscle differentiation. We present for the first time a description of this protein using in silico analysis. dapr was discovered through a previous study employing chromatin immunoprecipitation and CpG microarray analysis experiments as being regulated by myocyte-enhancing factor 2, a key transcription factor involved in the differentiation of skeletal muscle tissue. In this study we show that during the course of differentiation, Dapr binds to the PI3K signaling pathway member protein kinase B (PKB). In C2C12 myoblast cells before differentiation Dapr is localized to the cytosol, migrating with PKB to the membrane after initiation of muscle differentiation. Knockdown of Dapr by RNAi resulted in inhibition of myotube formation. Our findings indicate that Dapr is a key component required by myoblasts for orchestrating their differentiation during myogenesis. Furthermore, it appears that Dapr is involved in the PI3K signaling cascade, potentially acting as a scaffold protein for PKB and coordinating its compartmentalization during differentiation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».