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Enregistrement W2072635977 · doi:10.1074/jbc.m807000200

Identification and Characterization of a Novel Gene, dapr, Involved in Skeletal Muscle Differentiation and Protein Kinase B Signaling

2008· article· en· W2072635977 sur OpenAlexafffundabout
Carl Virtanen, James Paris, Mark Takahashi

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueUbiquitin and proteasome pathways
Établissements canadiensUniversity Health Network
Organismes subventionnairesUniversity Health NetworkGenome Canada
Mots-clésSkeletal muscleGeneIdentification (biology)Signal transductionBiologyProtein kinase AKinaseCell biologyGeneticsEndocrinologyBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The phosphatidylinositol 3-kinase (PI3K) signaling pathway has been associated with a variety of cellular functions ranging from cell cycle regulation to tissue development. Although years of research have extensively characterized this signaling pathway, little is known as to how specific cellular events are coordinated by its activation. Here we demonstrate that Dapr (differentiation-associated protein), a novel protein, appears to focus one aspect of this pathway by acting as a putative scaffold protein during skeletal muscle differentiation. We present for the first time a description of this protein using in silico analysis. dapr was discovered through a previous study employing chromatin immunoprecipitation and CpG microarray analysis experiments as being regulated by myocyte-enhancing factor 2, a key transcription factor involved in the differentiation of skeletal muscle tissue. In this study we show that during the course of differentiation, Dapr binds to the PI3K signaling pathway member protein kinase B (PKB). In C2C12 myoblast cells before differentiation Dapr is localized to the cytosol, migrating with PKB to the membrane after initiation of muscle differentiation. Knockdown of Dapr by RNAi resulted in inhibition of myotube formation. Our findings indicate that Dapr is a key component required by myoblasts for orchestrating their differentiation during myogenesis. Furthermore, it appears that Dapr is involved in the PI3K signaling cascade, potentially acting as a scaffold protein for PKB and coordinating its compartmentalization during differentiation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,232
Écart entre enseignants0,206 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2008
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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