Dissection of Differentially Regulated (G+C)-Rich Promoters of the Human Parathyroid Hormone (PTH)/PTH-Related Peptide Receptor Gene*
Notice bibliographique
Résumé
The PTH/PTH-related peptide (PTHrP) receptor (PTHR) is required for normal skeletal development, and a wide array of physiological responses mediated by PTH and PTHrP. We have previously identified three promoters, P1-P3, which control human PTHR gene transcription. P2 and P3 are (G+C)-rich, function in a number of tissues, lie within the same CpG island, and display many hallmarks of housekeeping promoters. However, they are differentially regulated during development as P2, but not P3, functions in fetal tissues. Here, we have used both stably and transiently transfected human osteoblast-like cells to delineate regions of P2 and P3 required for promoter activity. Deletion analyses performed in stably transfected cells indicated that sequences extending from -91 to -12 relative to the transcription start site were required for function of the P2 promoter. No negative regulatory elements were detected in P2. In contrast, deletion of an A-rich region of P3 extending from -147 to -115 was required for optimal basal activity, suggesting that this sequence acts as a repressor of P3. Strikingly, however, whereas the A-rich region also functioned as a negative element when inserted upstream of the (G+C)-rich P2 promoter, it enhanced expression from the thymidine kinase promoter, suggesting that its function depends on other transcription factors bound to promoter sequences. Fine deletion of P3 sequences proximal to -115 implicated Spl motifs and downstream initiation sites in P3 function. These studies indicate that function of P2 and P3 is controlled by ubiquitously expressed transcription factors and raise the possibility that P3 activity is repressed during fetal development.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».