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Enregistrement W2072721942 · doi:10.1186/1755-8794-4-72

"Who owns your poop?": insights regarding the intersection of human microbiome research and the ELSI aspects of biobanking and related studies

2011· article· en· W2072721942 sur OpenAlexafffundabout
Alice K. Hawkins, Kieran C. O’Doherty

Notice bibliographique

RevueBMC Medical Genomics · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueEthics in Clinical Research
Établissements canadiensUniversity of GuelphUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésBiobankMicrobiomeHuman microbiomeContext (archaeology)Data sharingEngineering ethicsHuman geneticsRelevance (law)Data scienceBiologyPolitical scienceMedicineBioinformaticsEngineeringComputer scienceGeneticsLaw

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: While the social, ethical, and legal implications of biobanking and large scale data sharing are already complicated enough, they may be further compounded by research on the human microbiome. DISCUSSION: The human microbiome is the entire complement of microorganisms that exists in and on every human body. Currently most biobanks focus primarily on human tissues and/or associated data (e.g. health records). Accordingly, most discussions in the social sciences and humanities on these issues are focused (appropriately so) on the implications of biobanks and sharing data derived from human tissues. However, rapid advances in human microbiome research involve collecting large amounts of data on microorganisms that exist in symbiotic relationships with the human body. Currently it is not clear whether these microorganisms should be considered part of or separate from the human body. Arguments can be made for both, but ultimately it seems that the dichotomy of human versus non-human and self versus non-self inevitably breaks down in this context. This situation has the potential to add further complications to debates on biobanking. SUMMARY: In this paper, we revisit some of the core problem areas of privacy, consent, ownership, return of results, governance, and benefit sharing, and consider how they might be impacted upon by human microbiome research. Some of the issues discussed also have relevance to other forms of microbial research. Discussion of these themes is guided by conceptual analysis of microbiome research and interviews with leading Canadian scientists in the field.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,077
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,061
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche, Intégrité de la recherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: Théorique ou conceptuel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,992
Score d'incertitude au seuil0,407

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0770,061
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0060,006
Études des sciences et des technologies0,0230,102
Communication savante0,0290,038
Science ouverte0,0030,020
Intégrité de la recherche0,0080,011
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,636
Tête enseignante GPT0,551
Écart entre enseignants0,085 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
DomaineMéthodes
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations81
Publié2011
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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