Use of PCR and DNA hybridization for identification of pear powdery mildew caused by <i>Podosphaera leucotricha</i>
Notice bibliographique
Résumé
Polymerase chain reaction (PCR) amplification of the ribosomal gene internal transcribed spacer (ITS) region has been used to classify Podosphaera leucotricha from apple but not pear. Molecular information is needed to show the relationship between apple and pear powdery mildew. DNA was successfully extracted from cleistothecia, conidia and mycelial fragments from leaves and shoots of apple, pear and six unrelated hosts with symptoms of powdery mildew. PCR amplification of the ITS regions of P. leucotricha with primers that amplify non-specific fungal DNA resulted in a 506 bp PCR product. Sequencing of the PCR products from apple and pear from different orchard blocks produced identical sequences for the ITS region that did not differ from P. leucotricha sequences in the GenBank database. The sequence data was also used to select species-specific oligonucleotides for P. leucotricha that could be used in a confirmatory hybridization assay. The hybridization reactions were positive for eight out of nine apple and pear powdery mildew samples. Six other hosts with powdery mildew symptoms were negative when tested with the assay and showed that this DNA test was specific for P. leucotricha. In conclusion the PCR and hybridization assays should prove to be useful tools in monitoring both apple and pear powdery mildew for epidemiological studies.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».