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Enregistrement W2072765132 · doi:10.1126/science.1243292

Phosphoinositide 3-Kinase δ Gene Mutation Predisposes to Respiratory Infection and Airway Damage

2013· article· en· W2072765132 sur OpenAlexaff
Ivan L. Ângulo, Oscar Vadas, Fabien Garçon, Edward Banham-Hall, Vincent Plagnol, Timothy Ronan Leahy, Helen Baxendale, Tanya Coulter, James Curtis, Changxin Wu, Katherine G. Blake-Palmer, Olga Perišić, Deborah J. Smyth, Mailis Maes, Christine Fiddler, Jatinder K. Juss, Deirdre Cilliers, Gašper Markelj, Anita Chandra, George E. Farmer, Anna Kielkowska, Jonathan Clark, Sven Kracker, Marianne Debré, Capucine Pïcard, Isabelle Pellier, Nada Jabado, James Morris, Gabriela Barcenas‐Morales, Alain Fischer, Len Stephens, Phillip T. Hawkins, Jeffrey C. Barrett, Mario Abinun, Menna R. Clatworthy, Anne Durandy, Rainer Döffinger, Edwin R. Chilvers, Andrew J. Cant, Dinakantha Kumararatne, Klaus Okkenhaug, Roger Williams, Alison M. Condliffe, Sergey Nejentsev

Notice bibliographique

RevueScience · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmunodeficiency and Autoimmune Disorders
Établissements canadiensMcGill UniversityMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilWellcome Trust
Mots-clésPhosphoinositide 3-kinaseGeneMutationRespiratory systemBiologyGeneticsMedicineImmunologySignal transductionInternal medicinePI3K/AKT/mTOR pathway

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Genetic mutations cause primary immunodeficiencies (PIDs) that predispose to infections. Here, we describe activated PI3K-δ syndrome (APDS), a PID associated with a dominant gain-of-function mutation in which lysine replaced glutamic acid at residue 1021 (E1021K) in the p110δ protein, the catalytic subunit of phosphoinositide 3-kinase δ (PI3Kδ), encoded by the PIK3CD gene. We found E1021K in 17 patients from seven unrelated families, but not among 3346 healthy subjects. APDS was characterized by recurrent respiratory infections, progressive airway damage, lymphopenia, increased circulating transitional B cells, increased immunoglobulin M, and reduced immunoglobulin G2 levels in serum and impaired vaccine responses. The E1021K mutation enhanced membrane association and kinase activity of p110δ. Patient-derived lymphocytes had increased levels of phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate and phosphorylated AKT protein and were prone to activation-induced cell death. Selective p110δ inhibitors IC87114 and GS-1101 reduced the activity of the mutant enzyme in vitro, which suggested a therapeutic approach for patients with APDS.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,231
Écart entre enseignants0,224 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations623
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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