Secondary Assays for Testing the Mode of Action of Natural Products with Bioactivity Against Fungi
Notice bibliographique
Résumé
Identification of novel antifungals is needed, and plant-derived compounds offer important leads in this respect. This article initiates a compendium of secondary assays for testing hypotheses on mode of action of plant-derived compounds. Three assays were developed to evaluate compounds that are hypothesized to effect cell wall function, transcription, and oxidative stress. A hypothesized perturbation on cell wall integrity by chimaphilin and Echinacea. root extracts was supported using sonication and heat shock assays. Heat shock treatments reduced the number of viable cells recovered when yeast was grown in the presence of subinhibitory concentrations of chimaphilin. A reduction in cell numbers was also observed with both sonication-based and heat shock–based assays when yeast was grown in the presence of Echinacea purpurea. (L.) Moench (Asteraceae) extracts. The hypothesis that chimaphilin impedes mRNA transcription processes was also supported by a β-galactosidase reporter gene assay. The antioxidant activity of nordihydroguaiaretic acid (NDGA) and ascorbic acid were assessed using a yeast strain that does not grow under hyperoxic conditions. At the concentrations assayed, NDGA did not remediate this sensitivity to hyperoxia, whereas ascorbic acid did. These and additional assays are further reviewed with an aim to collate and standardize secondary assays and streamline antifungal mode of action determinations.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».