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Enregistrement W2072829051 · doi:10.2135/cropsci2013.05.0298

Mapping Quantitative Trait Loci for Powdery Mildew Resistance in Flax (<i>Linum usitatissimum</i> L.)

2013· article· en· W2072829051 sur OpenAlexafffund
Parvaneh Asgarinia, Sylvie Cloutier, Scott Duguid, Khalid T. Rashid, Aghafakhr Mirlohi, Mitali Banik, Ghodratollah Saeidi

Notice bibliographique

RevueCrop Science · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePowdery Mildew Fungal Diseases
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesAgriculture and Agri-Food CanadaIsfahan University of Technology
Mots-clésPowdery mildewBiologyQuantitative trait locusLinumGeneticsGenetic linkagePopulationCultivarGene mappingPlant disease resistancePositional cloningMildewBotanyGenePhenotypeChromosome

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Powdery mildew (Oidium lini Skoric, [PM]), an obligate biotrophic ascomycete, is a common and widespread foliar disease of flax in most flax‐growing areas of the world. In this study, we constructed a linkage map using 143 simple sequence repeat (SSR) markers and an F2 population of 300 individuals generated from a cross between the susceptible cultivar NorMan and the resistant cultivar Linda. The F2–derived F3 families were phenotyped in the field and the F3–derived F4 families were phenotyped in a controlled environment growth chamber. The 15 linkage group map covered 1241 cM and was largely collinear with the previously published consensus map. Quantitative trait loci (QTL) analysis was performed and three PM resistance QTL located on LG1, 7, and 9 were identified consistently using phenotyping data from both field and growth chamber studies. These QTL explained 97% of the phenotypic variation exhibiting a mainly dominant gene action. This work represents a first step toward understanding the genetics of PM resistance in flax and map‐based cloning of candidate genes underlying the QTL.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,262
Écart entre enseignants0,228 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations42
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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