Identification of the Minimal Phosphoacceptor Site Required for in Vivo Activation of Interferon Regulatory Factor 3 in Response to Virus and Double-stranded RNA
Notice bibliographique
Résumé
The ubiquitously expressed latent interferon regulatory factor (IRF) 3 transcription factor is activated in response to virus infection by phosphorylation events that target a cluster of Ser/Thr residues, (382)GGASSLENTVDLHISNSHPLSLTSDQY(408) at the C-terminal end of the protein. To delineate the minimal phosphoacceptor sites required for IRF-3 activation, several point mutations were generated and tested for transactivation potential and cAMP-response element-binding protein-binding protein/p300 coactivator association. Expression of the IRF-3 S396D mutant alone was sufficient to induce type I IFN beta, IFNalpha1, RANTES, and the interferon-stimulated gene 561 promoters. Using SDS-PAGE and immunoblotting with a novel phosphospecific antibody, we show for the first time that, in vivo, IRF-3 is phosphorylated on Ser(396) following Sendai virus infection, expression of viral nucleocapsid, and double-stranded RNA treatment. These results demonstrate that Ser(396) within the C-terminal Ser/Thr cluster is targeted in vivo for phosphorylation following virus infection and plays an essential role in IRF-3 activation. The inability of the phosphospecific antibody to detect Ser(396) phosphorylation in lipopolysaccharide-treated cells suggests that other major pathways may be involved in IRF-3 activation following Toll-like receptor 4 stimulation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».