Global cellular changes induced by Legionella pneumophila infection of bone marrow-derived macrophages
Notice bibliographique
Résumé
The nucleotide-binding oligomerization domain (Nod)-like receptor (NLR) family member Naip5 plays an essential role in restricting Legionella pneumophila growth inside primary macrophages. Upon interaction with bacterial flagellin, the intracellular receptor Naip5 forms a multi-protein complex, the inflammasome, which activation has a protective role against infection. The A/J mouse strain carries a Naip5 allele (Naip5(A/J)), which renders its macrophages susceptible to Legionella infection. However, Naip5(A/J) is still competent for inflammasome activation suggesting that an as yet unidentified signaling pathway located downstream of Naip5 and defective in Naip5(A/J) macrophages regulates macrophage defenses against Legionella. Therefore, transcriptional profiling experiments with macrophages from C57BL/6J mice (B6), and from congenic mice (BcA75) carrying the partial loss-of-function A/J-derived allele (Naip5(A/J)) on a B6 background, infected or not with wild-type L. pneumophila or flagellin-deficient mutant were carried out to identify genes regulated by flagellin and by Naip5. Both the Legionella infection per se and the presence of flagellin had very strong effects on transcriptional responses of macrophages, 4h following infection, including modulation of cellular pathways associated with inflammatory response and cell survival. On the other hand, the presence of wild type or partial loss of function allele (Naip5(A/J)) at Naip5 did not cause large effects on transcriptional responses of macrophages to infection. We also examined in L. pneumophila infected macrophages, the effect of Naip5 alleles on expression and phosphorylation of 524 phosphoproteins, kinases and phosphatases involved in cell proliferation, immune response, stress and apoptosis. Naip5 alleles had an effect on the TLR-Il1R signaling pathway, the cell cycle and the caveolin-mediated response to pathogen. The results of transcriptome and proteome analyses were organized into cellular pathways in macrophages that are modulated in response to Legionella infection.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».