Identification of genes differentially expressed between benign and osteopontin transformed rat mammary epithelial cells
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Osteopontin is a secreted, integrin-binding and phosphorylated acidic glycoprotein which has an important role in tumor progression. FINDINGS: In this study, we have utilized suppressive subtractive hybridization (SSH) to evaluate OPN regulated gene expression, using the Rama 37 benign non-invasive rat mammary cell line and a subclone, Rama 37-OPN. Rama 37-OPN was produced by stably transfecting Rama 37 with an OPN expression vector and it demonstrates increased malignant properties in vitro. Sequence and expression array analysis of the respective cDNA libraries of over 1600 subtracted cDNA fragments revealed 982 ESTs, 45 novel sequences and 659 known genes. The known up-regulated genes in the Rama 37-OPN library code for proteins with a variety of functions including those involved in metabolism, cell adhesion and migration, signal transduction and in apoptosis. Four of the most differentially expressed genes between the benign and in vitro malignant rat mammary cell lines are tumor protein translationally controlled I (TPTI), aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator (ARNT), ataxia telangiectasia mutated (ATM) and RAN GTPase (RAN). The largest difference (ca 10,000 fold) between the less aggressively (MCF-7, ZR-75) and more aggressively malignant (MDA MB 231, MDA MB 435S) human breast cancer cell lines is that due to RAN, the next is that due to osteopontin itself. CONCLUSION: The results suggest that enhanced properties associated with the malignant state in vitro induced by osteopontin may be due to, in part, overexpression of RAN GTPase and these biological results are the subject of a subsequent publication 1.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».