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Enregistrement W2073065225 · doi:10.1159/000315076

Regulation of Human Cardiac Ion Channel Genes by MicroRNAs: Theoretical Perspective and Pathophysiological Implications

2010· article· en· W2073065225 sur OpenAlex
Xiaobin Luo, Haijun Zhang, Jiening Xiao, Zhiguo Wang

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueCellular Physiology and Biochemistry · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicroRNA in disease regulation
Établissements canadiensUniversité de MontréalMontreal Heart Institute
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésmicroRNAIon channelIn silicoComputational biologyBiologyBioinformaticsGene expressionGeneRegulation of gene expressionCell biologyGeneticsReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Excitability is a fundamental characteristic of cardiac cells, which is delicately determined by ion channel activities modulated by many factors. MicroRNA (miRNA) expression is dynamically regulated and altered miRNA expression can render expression deregulation of ion channel genes leading to channelopathies-arrhythmogenesis. Indeed, evidence has emerged indicating the crucial role of miRNAs in controlling cardiac excitability by regulating expression of ion channel genes at the post-transcriptional level. However, the very limited experimental data in the literature hinder our understanding of the role of miRNAs and the often one-to-one interaction between miRNA and ion-channel gene in the published studies also casts a doubt about fullness of our view. Unfortunately, currently available techniques do not permit thorough characterization of miRNA targeting; computational prediction programs remain the only source for rapid identification of a putative miRNA target in silico. We conducted a rationally designed bioinformatics analysis in conjunction with experimental approaches to identify the miRNAs from the currently available miRNA databases which have the potential to regulate human cardiac ion channel genes and to validate the analysis with several pathological settings associated with the deregulated miRNAs and ion channel genes in the heart. We established a matrix of miRNAs that are expressed in cardiac cells and have the potential to regulate the genes encoding cardiac ion channels and transporters. We were able to explain a particular ionic remodeling process in hypertrophy/heart failure, myocardial ischemia, or atrial fibrillation with the corresponding deregulated miRNAs under that pathological condition; the changes of miRNAs appear to have anti-correlation with the changes of many of the genes encoding cardiac ion channels under these situations. These results indicate that multiple miRNAs might be critically involved in the electrical/ionic remodeling processes of cardiac diseases through altering their expression in cardiac cells, which has not been uncovered by previous experimental studies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,024
Score d'incertitude au seuil0,619

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,224
Écart entre enseignants0,220 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle