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Enregistrement W2073089793 · doi:10.1196/annals.1375.041

Association of SUMO4 M55V Polymorphism with Autoimmune Diabetes in Latvian Patients

2006· article· en· W2073089793 sur OpenAlexaboutno aff
Saikiran K. Sedimbi, Arun Shastry, Yongsoo Park, I. Rumba, Carani B. Sanjeevi

Notice bibliographique

RevueAnnals of the New York Academy of Sciences · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDiabetes and associated disorders
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesVetenskapsrådet
Mots-clésType 1 diabetesAlleleDiabetes mellitusAutoimmune diabetesGeneticsGenetic predispositionRestriction fragment length polymorphismPolymorphism (computer science)GenotypeMedicineBiologyGeneEndocrinology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Small ubiquitin-related modifier (SUMO4), located in IDDM5, has been identified as a potential susceptibility gene for type 1 diabetes mellitus (T1DM). The novel polymorphism M55V, causing an amino acid change in the evolutionarily conserved met55 residue has been shown to activate the nuclear factor kappaB (NF-kappaB), hence the suspected role of SUMO4 in the pathogenicity of T1DM. The M55V polymorphism has been shown to be associated with susceptibility to T1DM in Asians, but not in Caucasians. Latent autoimmune diabetes in adults (LADA) is a slowly progressive form of T1DM and SUMO4 M55V has not been studied in LADA to date. The current study aims to test whether Latvians are similar to Caucasians in susceptibility to autoimmune diabetes (T1DM and LADA), with respect to SUMO4 M55V. We studied, age- and sex-matched, Latvian T1DM patients (n = 100) and healthy controls (n = 90) and LADA patients (n = 45) and healthy controls (n = 95). SUMO4 M55V polymorphism was analyzed using polymerase chain reaction (PCR)-restriction fragment length polymorphism (RFLP). The allelic frequencies of the A and G alleles were compared with HLA DR3-DR4-positive and HLA DR3-DR4-negative patients to identify any potential relation between HLA DR3-DR4 and SUMO4 M55V. We found no significant association between SUMO4 M55V and T1DM susceptibility in Latvians, the results being in concurrence with the previous studies in Caucasians of British and Canadian origin. Comparison of the A and G alleles with HLA DR3-DR4 did not result in any significant P values. No significant association was found between SUMO4 M55V and LADA. SUMO4 M55V is not associated with susceptibility to T1DM and LADA in Latvians, and Latvians exhibit similarity to other Caucasians with respect to association of SUMO4 M55V with autoimmune diabetes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,245
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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